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  SOFI simulation tool: A software package for simulating and testing super-resolution optical fluctuation imaging.

Girsault, A., Lukes, T., Sharipov, A., Geissbuehler, S., Leutenegger, M., Vandenberg, W., et al. (2016). SOFI simulation tool: A software package for simulating and testing super-resolution optical fluctuation imaging. PLoS One, 11(9): e0161602. doi:10.1371/journal.pone.0161602.

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2353144_Suppl_2.ZIP (Ergänzendes Material), 29MB
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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Girsault, A., Autor
Lukes, T., Autor
Sharipov, A., Autor
Geissbuehler, S., Autor
Leutenegger, M.1, Autor           
Vandenberg, W., Autor
Dedecker, P., Autor
Hofkens, J., Autor
Lasser, T., Autor
Affiliations:
1Department of NanoBiophotonics, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_578627              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Super-resolution optical fluctuation imaging (SOFI) allows one to perform sub-diffraction fluorescence microscopy of living cells. By analyzing the acquired image sequence with an advanced correlation method, i.e. a high-order cross-cumulant analysis, super-resolution in all three spatial dimensions can be achieved. Here we introduce a software tool for a simple qualitative comparison of SOFI images under simulated conditions considering parameters of the microscope setup and essential properties of the biological sample. This tool incorporates SOFI and STORM algorithms, displays and describes the SOFI image processing steps in a tutorial-like fashion. Fast testing of various parameters simplifies the parameter optimization prior to experimental work. The performance of the simulation tool is demonstrated by comparing simulated results with experimentally acquired data.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2016-09-01
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1371/journal.pone.0161602
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: PLoS One
Genre der Quelle: Zeitschrift
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Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: 13 Band / Heft: 11 (9) Artikelnummer: e0161602 Start- / Endseite: - Identifikator: -