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  Genes with monoallelic expression contribute disproportionately to genetic diversity in humans

Savova, V., Chun, S., Sohail, M., McCole, R. B., Witwicki, R., Gai, L., Lenz, T. L., Wu, C.-t., Sunyaev, S. R., & Gimelbrant, A. A. (2016). Genes with monoallelic expression contribute disproportionately to genetic diversity in humans. Nature Genetics,. doi:10.1038/ng.3493.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Savova_et_al_2016.pdf (出版社版), 638KB
 
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Savova_et_al_2016.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Evolutionary Biology, MPLM; )
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作成者

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 作成者:
Savova, Virginia, 著者
Chun, Sung, 著者
Sohail, Mashaal, 著者
McCole, Ruth B, 著者
Witwicki, Robert, 著者
Gai, Lisa, 著者
Lenz, Tobias L.1, 著者           
Wu, C-ting, 著者
Sunyaev, Shamil R, 著者
Gimelbrant, Alexander A, 著者
所属:
1Emmy Noether Research Group Evolutionary Immunogenomics, Department Evolutionary Ecology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_2068286              

内容説明

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キーワード: Epigenetics; population genetics
 要旨: An unexpectedly large number of human autosomal genes are subject to monoallelic expression (MAE). Our analysis of 4,227 such genes uncovers surprisingly high genetic variation across human populations. This increased diversity is unlikely to reflect relaxed purifying selection. Remarkably, MAE genes exhibit an elevated recombination rate and an increased density of hypermutable sequence contexts. However, these factors do not fully account for the increased diversity. We find that the elevated nucleotide diversity of MAE genes is also associated with greater allelic age: variants in these genes tend to be older and are enriched in polymorphisms shared by Neanderthals and chimpanzees. Both synonymous and nonsynonymous alleles of MAE genes have elevated average population frequencies. We also observed strong enrichment of the MAE signature among genes reported to evolve under balancing selection. We propose that an important biological function of widespread MAE might be the generation of cell-to-cell heterogeneity; the increased genetic variation contributes to this heterogeneity.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2014-12-142015-12-232016-01-25
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/ng.3493
PMID: 26808112
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Genetics
  その他 : Nature Genet.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Nature America, Inc.
ページ: 10 Seiten 巻号: - 通巻号: 3493 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1061-4036
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925598609