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  Low-input Capture-C: A chromosome conformation capture assay to analyze chromatin architecture in small numbers of cells

Oudelaar, A. M., Downes, D. J., Davies, J. O. J., & Hughes, J. R. (2017). Low-input Capture-C: A chromosome conformation capture assay to analyze chromatin architecture in small numbers of cells. Bio-Protocol, 7(23): e2645. doi:10.21769/BioProtoc.2645.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Oudelaar, A. M.1, Autor           
Downes, D. J., Autor
Davies, J. O. J., Autor
Hughes, J. R., Autor
Affiliations:
1Lise Meitner Group Genome Organization and Regulation, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_3261271              

Inhalt

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Schlagwörter: Nuclear organization, Chromatin architecture, Chromosome conformation capture (3C), Capture-C, Low input, Small cell numbers
 Zusammenfassung: Chromosome conformation capture (3C) techniques are crucial to understanding tissue-specific regulation of gene expression, but current methods generally require large numbers of cells. This protocol describes two new low-input Capture-C approaches that can generate high-quality 3C interaction profiles from 10,000-20,000 cells, depending on the resolution used for analysis.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2017-12-05
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.21769/BioProtoc.2645
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Bio-Protocol
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 7 (23) Artikelnummer: e2645 Start- / Endseite: - Identifikator: -