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  An in silico-in vitro pipeline identifying an HLA-A*02:01+ KRAS G12V+ spliced epitope candidate for a broad tumor-immune response in cancer patients.

Mishto, M., Mansurkhodzhaev, A., Ying, G., Bitra, A., Cordfunke, R. A., Henze, S., Paul, D., Sidney, J., Urlaub, H., Neefjes, J., Sette, A., Zajonc, D. M., & Liepe, J. (2019). An in silico-in vitro pipeline identifying an HLA-A*02:01+ KRAS G12V+ spliced epitope candidate for a broad tumor-immune response in cancer patients. Frontiers in Immunology, 10:. doi:10.3389/fimmu.2019.02572.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0005-53A9-F 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0005-620C-0
資料種別: 学術論文

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3181124.pdf (出版社版), 3MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0005-620D-F
ファイル名:
3181124.pdf
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-
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-
:
3181124_Suppl.pdf (付録資料), 317KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0005-620E-E
ファイル名:
3181124_Suppl.pdf
説明:
-
OA-Status:
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公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
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-
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Mishto, M., 著者
Mansurkhodzhaev, A.1, 著者           
Ying, G., 著者
Bitra, A., 著者
Cordfunke, R. A., 著者
Henze, S., 著者
Paul, D., 著者
Sidney, J., 著者
Urlaub, H.2, 著者           
Neefjes, J., 著者
Sette, A., 著者
Zajonc, D. M., 著者
Liepe, J.1, 著者           
所属:
1Research Group of Quantitative and System Biology, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_2466694              
2Research Group of Bioanalytical Mass Spectrometry, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_578613              

内容説明

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キーワード: KRAS; adoptive T cell therapy targets; antigen presentation; cancer epitopes; peptide splicing; proteasome; tumor immunology
 要旨: Targeting CD8+ T cells to recurrent tumor-specific mutations can profoundly contribute to cancer treatment. Some of these mutations are potential tumor antigens although they can be displayed by non-spliced epitopes only in a few patients, because of the low affinity of the mutated non-spliced peptides for the predominant HLA class I alleles. Here, we describe a pipeline that uses the large sequence variety of proteasome-generated spliced peptides and identifies spliced epitope candidates, which carry the mutations and bind the predominant HLA-I alleles with high affinity. They could be used in adoptive T cell therapy and other anti-cancer immunotherapies for large cohorts of cancer patients. As a proof of principle, the application of this pipeline led to the identification of a KRAS G12V mutation-carrying spliced epitope candidate, which is produced by proteasomes, transported by TAPs and efficiently presented by the most prevalent HLA class I molecules, HLA-A*02:01 complexes.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2019-11-152019
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.3389/fimmu.2019.02572
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Frontiers in Immunology
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: 17 巻号: 10 通巻号: 2572 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -