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  A structural model of PpoA derived from SAXS-analysis-Implications for substrate conversion.

Koch, C., Tria, G., Fielding, A., Brodhun, F., Valerius, O., Feussner, K., Braus, G. H., Svergun, D. I., Bennati, M., & Feussner, I. (2013). A structural model of PpoA derived from SAXS-analysis-Implications for substrate conversion. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids, 1831(9), 1449-1457. doi:10.1016/j.bbalip.2013.06.003.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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1835483.pdf (出版社版), 2MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-4DEE-2
ファイル名:
1835483.pdf
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公開
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application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-
:
1835483_Supplement_1.htm (付録資料), 80KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-4DEF-F
ファイル名:
1835483_Supplement_1.htm
説明:
-
OA-Status:
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
text/html / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

作成者

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 作成者:
Koch, C., 著者
Tria, G., 著者
Fielding, A.1, 著者           
Brodhun, F., 著者
Valerius, O., 著者
Feussner, K., 著者
Braus, G. H., 著者
Svergun, D. I., 著者
Bennati, M.1, 著者           
Feussner, I., 著者
所属:
1Research Group of Electron Paramagnetic Resonance, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_578606              

内容説明

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キーワード: Cytochrome P450; Dioxygenase; Double electron-electron resonance; Oxylipin; Psi-factor producing oxygenase; Small-angle X-ray scattering
 要旨: In plants and mammals, oxylipins may be synthesized via multi step processes that consist of dioxygenation and isomerization of the intermediately formed hydroperoxy fatty acid. These processes are typically catalyzed by two distinct enzyme classes: dioxygenases and cytochrome P450 enzymes. In ascomycetes biosynthesis of oxylipins may proceed by a similar two-step pathway. An important difference, however, is that both enzymatic activities may be combined in a single bifunctional enzyme. These types of enzymes are named Psi-factor producing oxygenases (Ppo). Here, the spatial organization of the two domains of PpoA from Aspergillus nidulans was analyzed by small-angle X-ray scattering and the obtained data show that the enzyme exhibits a relatively flat trimeric shape. Atomic structures of the single domains were obtained by template-based structure prediction and docked into the enzyme envelope of the low resolution structure obtained by SAXS. EPR-based distance measurements between the tyrosyl radicals formed in the activated dioxygenase domain of the enzyme supported the trimeric structure obtained from SAXS and the previous assignment of Tyr374 as radical-site in PpoA. Furthermore, two phenylalanine residues in the cytochrome P450 domain were shown to modulate the specificity of hydroperoxy fatty acid rearrangement.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2013-06-212013-09
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1016/j.bbalip.2013.06.003
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 1831 (9) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1449 - 1457 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -