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  A deep proteomics perspective on CRM1-mediated nuclear export and nucleocytoplasmic partitioning.

Kirli, K., Karaca, S., Dehne, H. J., Samwer, M., Pan, K. T., Lenz, C., Urlaub, H., & Görlich, D. (2015). A deep proteomics perspective on CRM1-mediated nuclear export and nucleocytoplasmic partitioning. eLife, 4:. doi:10.7554/eLife.11466.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Kirli, K.1, 著者           
Karaca, S.2, 著者           
Dehne, H. J.1, 著者           
Samwer, M., 著者
Pan, K. T.2, 著者           
Lenz, C.2, 著者           
Urlaub, H.2, 著者           
Görlich, D.1, 著者           
所属:
1Department of Cellular Logistics, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_578574              
2Research Group of Bioanalytical Mass Spectrometry, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_578613              

内容説明

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キーワード: S. cerevisiae; biochemistry; cell biology; human; xenopus
 要旨: CRM1 is a highly conserved, RanGTPase-driven exportin that caries proteins and RNPs from the nucleus to the cytoplasm. We now explored the cargo-spectrum of CRM1 in depth and identified surprisingly large numbers, namely >700 export substrates from the yeast S. cerevisiae, ≈ 1000 from Xenopus oocytes and >1050 from human cells. In addition, we quantified the partitioning of ≈5000 unique proteins between nucleus and cytoplasm of Xenopus oocytes. The data suggest new CRM1 functions in spatial control of vesicle coat-assembly, centrosomes, autophagy, peroxisome biogenesis, cytoskeleton, ribosome maturation, translation, mRNA degradation, and more generally in precluding a potentially detrimental action of cytoplasmic pathways within the nuclear interior. There are also numerous new instances where CRM1 appears to act in regulatory circuits. Altogether, our dataset allows unprecedented insights into the nucleocytoplasmic organisation of eukaryotic cells, into the contributions of an exceedingly promiscuous exportin and it provides a new basis for NES prediction.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2015-12-17
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.7554/eLife.11466
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: eLife
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: 28 巻号: 4 通巻号: e11466 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -