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  Genome-wide strategies identify downstream target genes of connective tissue-associated transcription factors

Orgeur, M., Martens, M., Leonte, G., Nassari, S., Bonnin, M.-A., Börno, S. T., Timmermann, B., Hecht, J., Duprez, D., & Stricker, S. (2018). Genome-wide strategies identify downstream target genes of connective tissue-associated transcription factors. Development, 145(7):. doi:10.1242/dev.161208.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0000-E315-8 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0004-5AD0-C
資料種別: 学術論文

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:
Orgeur.pdf (全文テキスト(全般)), 5MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0000-E317-6
ファイル名:
Orgeur.pdf
説明:
-
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公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
© 2018. Published by The Company of Biologists Ltd
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Orgeur, Mickael , 著者
Martens, Marvin , 著者
Leonte, Georgeta , 著者
Nassari, Sonya , 著者
Bonnin, Marie-Ange , 著者
Börno, Stefan T.1, 著者           
Timmermann, Bernd1, 著者           
Hecht, Jochen, 著者
Duprez, Delphine , 著者
Stricker, Sigmar2, 著者           
所属:
1Sequencing (Head: Bernd Timmermann), Scientific Service (Head: Christoph Krukenkamp), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479670              
2Research Group Development & Disease (Head: Stefan Mundlos), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433557              

内容説明

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キーワード: Chicken model; Connective tissue differentiation; Extracellular matrix; Limb development; Signalling pathways; Transcription factors; Transcriptional regulatory network
 要旨: Connective tissues support organs and play crucial roles in development, homeostasis and fibrosis, yet our understanding of their formation is still limited. To gain insight into the molecular mechanisms of connective tissue specification, we selected five zinc finger transcription factors - OSR1, OSR2, EGR1, KLF2 and KLF4 - based on their expression patterns and/or known involvement in connective tissue subtype differentiation. RNA-seq and ChIP-seq profiling revealed a set of common genes regulated by all five transcription factors, which we propose as connective tissue core expression set. This common core was enriched in genes associated with axon guidance and myofibroblast signature, including fibrosis-related genes. In addition, each transcription factor regulated a specific set of signalling molecules and extracellular matrix components. This suggests a concept whereby local molecular niches can be created via the expression of specific transcription factors impinging on the specification of local microenvironments. The regulatory network established here identifies common and distinct molecular signatures of limb connective tissue subtypes, provides novel insight into the signalling pathways governing connective tissue specification, and serves as a resource for connective tissue development.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2018-02-242018-03-29
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: 16
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1242/dev.161208
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Development
  その他 : Development
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Cambridge, Cambridgeshire : Company of Biologists
ページ: - 巻号: 145 (7) 通巻号: dev161208 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0950-1991
PII: dev.161208
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954927546241