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  MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches.

Mirdita, M., Steinegger, M., & Söding, J. (2019). MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches. Bioinformatics, 35(16), 2856-2858. doi:10.1093/bioinformatics/bty1057.

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Genre: Zeitschriftenartikel

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3017752.pdf (Verlagsversion), 199KB
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3017752.pdf
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-
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Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
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3017752_Suppl.pdf (Ergänzendes Material), 137KB
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3017752_Suppl.pdf
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Öffentlich
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-
Lizenz:
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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Mirdita, M.1, Autor           
Steinegger, M.1, Autor           
Söding, J.1, Autor           
Affiliations:
1Research Group of Computational Biology, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_1933286              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Summary:

The MMseqs2 desktop and web server app facilitates interactive sequence searches through custom protein sequence and profile databases on personal workstations. By eliminating MMseqs2's runtime overhead, we reduced response times to a few seconds at sensitivities close to BLAST.
Availability and implementation:

The app is easy to install for non-experts. GPLv3-licensed code, prebuilt desktop app packages for Windows, macOS and Linux, Docker images for the web server application, and a demo web server are available at https://search.mmseqs.com.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2019-01-072019-08-15
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1093/bioinformatics/bty1057
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Bioinformatics
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
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Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 35 (16) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 2856 - 2858 Identifikator: -