Deutsch
 
Hilfe Datenschutzhinweis Impressum
  DetailsucheBrowse

Datensatz

 
 
DownloadE-Mail
  High-yield spin labeling of long RNAs for electron paramagnetic resonance spectroscopy

Kerzhner, M., Matsuoka, H., Wuebben, C., Famulok, M., & Schiemann, O. (2018). High-yield spin labeling of long RNAs for electron paramagnetic resonance spectroscopy. Biochemistry, 57(20), 2923-2931. doi:10.1021/acs.biochem.8b00040.

Item is

Basisdaten

einblenden: ausblenden:
Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

einblenden:
ausblenden:
externe Referenz:
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.biochem.8b00040 (Zusammenfassung)
Beschreibung:
-
OA-Status:

Urheber

einblenden:
ausblenden:
 Urheber:
Kerzhner, Mark1, Autor
Matsuoka, Hideto1, Autor
Wuebben, Christine1, Autor
Famulok, Michael2, Autor
Schiemann, Olav1, Autor
Affiliations:
1External Organizations, ou_persistent22              
2Max Planck Fellow Chemical Biology, Center of Advanced European Studies and Research (caesar), Max Planck Society, Ludwig-Erhard-Allee 2, 53175 Bonn, DE, ou_2173681              

Inhalt

einblenden:
ausblenden:
Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Site-directed spin labeling is a powerful tool for investigating the conformation and dynamics of biomacromolecules such as RNA. Here we introduce a spin labeling strategy based on click chemistry in solution that, in combination with enzymatic ligation, allows highly efficient labeling of complex and long RNAs with short reaction times and suppressed RNA degradation. With this approach, a 34-nucleotide aptamer domain of the preQ1 riboswitch and an 81-nucleotide TPP riboswitch aptamer could be labeled with two labels in several positions. We then show that conformations of the preQ1 aptamer and its dynamics can be monitored in the absence and presence of Mg2+ and a preQ1 ligand by continuous wave electron paramagnetic resonance spectroscopy at room temperature and pulsed electron-electron double resonance spectroscopy (PELDOR or DEER) in the frozen state.

Details

einblenden:
ausblenden:
Sprache(n): eng - English
 Datum: 2018-05-102018-05-22
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: ISI: 000433404600004
DOI: 10.1021/acs.biochem.8b00040
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

einblenden:

Entscheidung

einblenden:

Projektinformation

einblenden:

Quelle 1

einblenden:
ausblenden:
Titel: Biochemistry
  Kurztitel : Biochemistry
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Columbus, Ohio : American Chemical Society
Seiten: - Band / Heft: 57 (20) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 2923 - 2931 Identifikator: ISSN: 0006-2960
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925384103