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  A multilaboratory comparison of calibration accuracy and the performance of external references in analytical ultracentrifugation.

Zhao, H., Ghirlando, R., Alfonso, C., Arisaka, F., Attali, H., Bain, D. L., Bakhtina, M. M., Becker, D. F., Bedwell, G. J., Bekdemir, A., Besong, T. M. D., Birck, C., Brautigam, C. A., Brennerman, W., Byron, O., Bzowska, A., Chaires, J. B., Chaton, C. T., Cölfen, H., Connaghan, K. D., Crowley, K. A., Curth, U., Daviter, T., Dean, W. L., Díez, A. I., Ebel, C., Eckert, D. M., Eisele, L. E., Eisenstein, E., England, P., Escalante, C., Fagan, J. A., Fairman, R., Finn, R. M., Fischle, W., García de la Torre, J., Gor, J., Gustafsson, H., Hall, D., Harding, S. E., Hernández Cifre, J. G., Herr, A. B., Howell, E. E., Isaac, R. S., Jao, S. C., Jose, D., Kim, S. J., Kokona, B., Kornblatt, J. A., Kosek, D., Krayukhinac, E., Krzizike, D., Kusznir, E. A., Kwon, H., Larson, A., Laue, T. M., Le Roy, A., Leech, A. P., Lilie, H., Luger, K., Luque-Ortega, J. R., Ma, J., May, C. A., Maynard, E. L., Modrak-Wojcik, A., Mok, Y. F., Mücke, N., Nagel-Steger, L., Narlikar, G. J., Nodac, M., Nourse, A., Obsil, T., Park, C. K., Park, J. K., Pawelek, P. D., Perdue, E. E., Perkins, S. J., Perugini, M. A., Peterson, C. L., Peverelli, M. G., Piszczek, G., Prag, G., Prevelige, P. E., Raynal, B. D. E., Rezabkova, L., Richter, K., Ringel, A. E., Rosenberg, R., Rowe, A. J., Rufer, A. C., Scott, D. J., Seravalli, J. G., Solovyova, A. S., Song, R., Staunton, D., Stoddard, C., Stott, K., Strauss, H. M., Streicherd, W. W., Sumida, J. P., Swygert, S. G., Szczepanowski, R. H., Tessmer, I., Toth, R. T., Tripathy, A., Uchiyama, S., Uebel, S. F. W., Unzai, S., Vitlin, A., Gruber, P., von Hippel, H., Wandrey, C., Wang, S.-H., Weitzel, S. E., Wielgus-Kutrowska, B., Wolberger, C., Wolff, M., Wright, E., Wu, Y. S., Wubben, J. M., & Schuck, P. (2015). A multilaboratory comparison of calibration accuracy and the performance of external references in analytical ultracentrifugation. PLOS One, 10(5):. doi:10.1371/journal.pone.0126420.

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資料種別: 学術論文

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2174950.pdf (出版社版), 2MB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0027-F4DE-6
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Zhao, H., 著者
Ghirlando, R., 著者
Alfonso, C., 著者
Arisaka, F., 著者
Attali, H., 著者
Bain, D. L., 著者
Bakhtina, M. M., 著者
Becker, D. F., 著者
Bedwell, G. J., 著者
Bekdemir, A., 著者
Besong, T. M. D., 著者
Birck, C., 著者
Brautigam, C. A., 著者
Brennerman, W., 著者
Byron, O., 著者
Bzowska, A., 著者
Chaires, J. B., 著者
Chaton, C. T., 著者
Cölfen, H., 著者
Connaghan, K. D., 著者
Crowley, K. A., 著者Curth, U., 著者Daviter, T., 著者Dean, W. L., 著者Díez, A. I., 著者Ebel, C., 著者Eckert, D. M., 著者Eisele, L. E., 著者Eisenstein, E., 著者England, P., 著者Escalante, C., 著者Fagan, J. A., 著者Fairman, R., 著者Finn, R. M., 著者Fischle, W.1, 著者           García de la Torre, J., 著者Gor, J., 著者Gustafsson, H., 著者Hall, D., 著者Harding, S. E., 著者Hernández Cifre, J. G. , 著者Herr, A. B., 著者Howell, E. E., 著者Isaac, R. S., 著者Jao, S. C., 著者Jose, Davis, 著者Kim, S. J., 著者Kokona, B., 著者Kornblatt, J. A., 著者Kosek, D., 著者Krayukhinac, E., 著者Krzizike, D., 著者Kusznir, E. A., 著者Kwon, H., 著者Larson, A., 著者Laue, T. M., 著者Le Roy, A., 著者Leech, A. P., 著者Lilie, H., 著者Luger, K., 著者Luque-Ortega, J. R., 著者Ma, J., 著者May, C. A., 著者Maynard, E. L., 著者Modrak-Wojcik, A., 著者Mok, Y. F., 著者Mücke, N., 著者Nagel-Steger, L., 著者Narlikar, G. J., 著者Nodac, M., 著者Nourse, A., 著者Obsil, T., 著者Park, C. K., 著者Park, J. K., 著者Pawelek, P. D., 著者Perdue, E. E., 著者Perkins, S. J., 著者Perugini, M. A., 著者Peterson, C. L., 著者Peverelli, M. G., 著者Piszczek, G., 著者Prag, G., 著者Prevelige, P. E., 著者Raynal, B. D. E., 著者Rezabkova, L., 著者Richter, K., 著者Ringel, A. E., 著者Rosenberg, R., 著者Rowe, A. J., 著者Rufer, A. C., 著者Scott, D. J., 著者Seravalli, J. G., 著者Solovyova, A. S., 著者Song, R., 著者Staunton, D., 著者Stoddard, C., 著者Stott, K., 著者Strauss, H. M., 著者Streicherd, W. W., 著者Sumida, J. P., 著者Swygert, S. G., 著者Szczepanowski, R. H., 著者Tessmer, I., 著者Toth, R. T., 著者Tripathy, A., 著者Uchiyama, S., 著者Uebel, S. F. W., 著者Unzai, S., 著者Vitlin, A., 著者Gruber, P., 著者von Hippel, H., 著者Wandrey, C., 著者Wang, Szu-Huan, 著者Weitzel, S. E., 著者Wielgus-Kutrowska, B., 著者Wolberger, C., 著者Wolff, M., 著者Wright, E., 著者Wu, Y. S., 著者Wubben, J. M., 著者Schuck, P., 著者 全て表示
所属:
1Research Group of Chromatin Biochemistry, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_578604              

内容説明

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 要旨: Analytical ultracentrifugation (AUC) is a first principles based method to determine absolute sedimentation coefficients and buoyant molar masses of macromolecules and their complexes, reporting on their size and shape in free solution. The purpose of this multi-laboratory study was to establish the precision and accuracy of basic data dimensions in AUC and validate previously proposed calibration techniques. Three kits of AUC cell assemblies containing radial and temperature calibration tools and a bovine serum albumin (BSA) reference sample were shared among 67 laboratories, generating 129 comprehensive data sets. These allowed for an assessment of many parameters of instrument performance, including accuracy of the reported scan time after the start of centrifugation, the accuracy of the temperature calibration, and the accuracy of the radial magnification. The range of sedimentation coefficients obtained for BSA monomer in different instruments and using different optical systems was from 3.655 S to 4.949 S, with a mean and standard deviation of (4.304 +/- 0.188) S (4.4%). After the combined application of correction factors derived from the external calibration references for elapsed time, scan velocity, temperature, and radial magnification, the range of s-values was reduced 7-fold with a mean of 4.325 S and a 6-fold reduced standard deviation of +/- 0.030 S (0.7%). In addition, the large data set provided an opportunity to determine the instrument-to-instrument variation of the absolute radial positions reported in the scan files, the precision of photometric or refractometric signal magnitudes, and the precision of the calculated apparent molar mass of BSA monomer and the fraction of BSA dimers. These results highlight the necessity and effectiveness of independent calibration of basic AUC data dimensions for reliable quantitative studies.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2015-05-21
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1371/journal.pone.0126420
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出版物名: PLOS One
種別: 学術雑誌
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出版社, 出版地: -
ページ: 30 巻号: 10 (5) 通巻号: e0126420 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -