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  Polymorphism and signature of selection in the MHC class I genes of the three-spined stickleback Gasterosteus aculeatus

Schaschl, H., & Wegner, K. M. (2006). Polymorphism and signature of selection in the MHC class I genes of the three-spined stickleback Gasterosteus aculeatus. Journal of Fish Biology, 89(Suppl. B), 177-188. doi:10.1111/j.1095-8649.2006.01223.x.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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schaschl_2006.pdf (出版社版), 151KB
 
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ファイル名:
schaschl_2006.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Evolutionary Biology, MPLM; )
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf
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著作権情報:
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CCライセンス:
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作成者

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 作成者:
Schaschl, H.1, 著者           
Wegner, K. M.1, 著者           
所属:
1Department Evolutionary Ecology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_1445634              

内容説明

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キーワード: Gasterosteus aculeatus; MHC class I diversity; positive selection; SSCP
 要旨: The role and intensity of positive selection maintaining the polymorphism of major histocompatibility complex (MHC) class I genes in the three-spined stickleback Gasterosteus aculeams was investigated. The highly polymorphic set of MHC class I genes found was organized in a single linkage group. Between 5 and 14 sequence variants per individual were identified by single-stranded conformation polymorphism (SSCP) analysis. Segregation analysis studied in 10 three-spined stickleback families followed the expected pattern of Mendelian inheritance. The gamete fusion in three-spined stickleback thus seems to be random with respect to the MHC class I genes. The DNA sequence analyses showed that the expressed MHC class I loci are under strong selection pressure, possibly mediated by parasites. Codons that were revealed to be under positive selection are potentially important in antigen binding. MHC class I sequences did not form significant supported clusters within a phylogenetic tree. Analogous to MHC class II genes, it was not possible to assign the class I sequences to a specific locus, suggesting that the class I genes may have been generated by recent gene duplication.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2006-12
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 299088
DOI: 10.1111/j.1095-8649.2006.01223.x
その他: 2525/S 38666
 学位: -

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Journal of Fish Biology
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 89 (Suppl. B) 通巻号: - 開始・終了ページ: 177 - 188 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0022-1112