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  Increased versatility despite reduced molecular complexity – evolution, structure and function of metazoan splicing factor PRPF39

De Bortoli, F., Neumann, A., Kotte, A., Timmermann, B., Schüler, T., Wahl, M. C., et al. (2019). Increased versatility despite reduced molecular complexity – evolution, structure and function of metazoan splicing factor PRPF39. Nucleic Acids Research (London), gkz243. doi:10.1093/nar/gkz243.

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Genre: Zeitschriftenartikel

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:
De Bortoli.pdf (Verlagsversion), 14MB
Name:
De Bortoli.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
© The Author(s) 2019

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
De Bortoli, Francesca , Autor
Neumann, Alexander, Autor
Kotte, Ana, Autor
Timmermann, Bernd1, Autor           
Schüler, Thomas , Autor
Wahl, Markus C. , Autor
Loll, Bernhard, Autor
Heyd, Florian , Autor
Affiliations:
1Sequencing (Head: Bernd Timmermann), Scientific Service (Head: Christoph Krukenkamp), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479670              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: In the yeast U1 snRNP the Prp39/Prp42 heterodimer is essential for early steps of spliceosome assembly. In metazoans no Prp42 ortholog exists, raising the question how the heterodimer is functionally substituted. Here we present the crystal structure of murine PRPF39, which forms a homodimer. Structure-guided point mutations disrupt dimer formation and inhibit splicing, manifesting the homodimer as functional unit. PRPF39 expression is controlled by NMD-inducing alternative splicing in mice and human, suggesting a role in adapting splicing efficiency to cell type specific requirements. A phylogenetic analysis reveals coevolution of shortened U1 snRNA and the absence of Prp42, which correlates with overall splicing complexity in different fungi. While current models correlate the diversity of spliceosomal proteins with splicing complexity, our study highlights a contrary case. We find that organisms with higher splicing complexity have substituted the Prp39/Prp42 heterodimer with a PRPF39 homodimer.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2019-03-252019-04-05
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: DOI: 10.1093/nar/gkz243
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nucleic Acids Research (London)
  Andere : Nucleic Acids Res
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Oxford : Oxford University Press
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: gkz243 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 0305-1048
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/110992357379342