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  Small synthetic molecule-stabilized RNA pseudoknot as an activator for -1 ribosomal frameshifting.

Matsumoto, S., Calsikan, N., Rodnina, M. V., Murata, A., & Nakatani, K. (2018). Small synthetic molecule-stabilized RNA pseudoknot as an activator for -1 ribosomal frameshifting. Nucleic Acids Research, 46(16), 8079-8089. doi:10.1093/nar/gky689.

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Genre: Zeitschriftenartikel

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2632108.pdf (Verlagsversion), 3MB
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2632108.pdf
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Gold
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application/pdf / [MD5]
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2632108_Suppl.htm (Ergänzendes Material), 434KB
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Keine Angabe
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Öffentlich
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Copyright Info:
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Lizenz:
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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Matsumoto, S., Autor
Calsikan, N., Autor
Rodnina, M. V.1, Autor           
Murata, A., Autor
Nakatani, K., Autor
Affiliations:
1Department of Physical Biochemistry, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_578598              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Programmed -1 ribosomal frameshifting (-1PRF) is a recoding mechanism to make alternative proteins from a single mRNA transcript. -1PRF is stimulated by cis-acting signals in mRNA, a seven-nucleotide slippery sequence and a downstream secondary structure element, which is often a pseudoknot. In this study we engineered the frameshifting pseudoknot from the mouse mammary tumor virus to respond to a rationally designed small molecule naphthyridine carbamate tetramer (NCTn). We demonstrate that NCTn can stabilize the pseudoknot structure in mRNA and activate -1PRF both in vitro and in human cells. The results illustrate how NCTn-inducible -1PRF may serve as an important component of the synthetic biology toolbox for the precise control of gene expression using small synthetic molecules.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2018-08-022018-09-19
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1093/nar/gky689
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nucleic Acids Research
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 46 (16) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 8079 - 8089 Identifikator: -