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  Towards automatic protein backbone assignment using proton-detected 4D solid-state NMR data.

Xiang, S. Q., Chevelkov, V., Becker, S., & Lange, A. (2014). Towards automatic protein backbone assignment using proton-detected 4D solid-state NMR data. Journal of Biomolecular NMR, 60(2-3), 85-90. doi:10.1007/s10858-014-9859-6.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0024-246E-D Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0028-DD39-C
Genre: Zeitschriftenartikel

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2069432.pdf (Verlagsversion), 984KB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0024-2470-5
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2069432_Suppl.pdf
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Beschreibung:
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OA-Status:

Urheber

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 Urheber:
Xiang, S. Q., Autor
Chevelkov, V.1, Autor           
Becker, S.1, Autor           
Lange, A.1, Autor           
Affiliations:
1Department of NMR Based Structural Biology, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_578567              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: We introduce an efficient approach for sequential protein backbone assignment based on two complementary proton-detected 4D solid-state NMR experiments that correlate HNi /Ni with CAi/COi or CAi−1/COi−1. The resulting 4D spectra exhibit excellent sensitivity and resolution and are amenable to (semi-)automatic assignment approaches. This strategy allows to obtain sequential connections with high confidence as problems related to peak overlap and multiple assignment possibilities are avoided. Non-uniform sampling schemes were implemented to allow for the acquisition of 4D spectra within a few days. Rather moderate hardware requirements enable the successful demonstration of the method on deuterated type III secretion needles using a 600 MHz spectrometer at a spinning rate of 25 kHz.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2014-09-062014-11
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1007/s10858-014-9859-6
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Journal of Biomolecular NMR
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 60 (2-3) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 85 - 90 Identifikator: -