MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence 
searches.

Mirdita, M.; Steinegger, M.; Söding, J.

doi:10.1093/bioinformatics/bty1057

MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches.

Mirdita, M., Steinegger, M., & Söding, J. (2019). MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches. Bioinformatics, 35(16), 2856-2858. doi:10.1093/bioinformatics/bty1057.

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Mirdita, M.¹, 著者
Steinegger, M.¹, 著者
Söding, J.¹, 著者

所属:
1Research Group of Computational Biology, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_1933286

内容説明

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キーワード: -

要旨: Summary:

The MMseqs2 desktop and web server app facilitates interactive sequence searches through custom protein sequence and profile databases on personal workstations. By eliminating MMseqs2's runtime overhead, we reduced response times to a few seconds at sensitivities close to BLAST.
Availability and implementation:

The app is easy to install for non-experts. GPLv3-licensed code, prebuilt desktop app packages for Windows, macOS and Linux, Docker images for the web server application, and a demo web server are available at https://search.mmseqs.com.

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言語: eng - English

日付: オンライン出版: 2019-01-07出版: 2019-08-15

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査読: 査読あり

識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1093/bioinformatics/bty1057

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出版物名: Bioinformatics

種別: 学術雑誌

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ページ: - 巻号: 35 (16) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2856 - 2858 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -

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