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  Inference of a mesoscopic population model from population spike trains

René, A., Longtin, A., & Macke, J. H. (2020). Inference of a mesoscopic population model from population spike trains. Neural computation, 32(8), 1448-1498. doi:10.1162/neco_a_01292.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0006-D06B-7 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0008-5FFE-1
資料種別: 学術論文

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:
neco_a_01292.pdf (全文テキスト(全般)), 4MB
 
ファイルのパーマリンク:
-
ファイル名:
neco_a_01292.pdf
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閲覧制限:
非公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

関連URL

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OA-Status:
URL:
https://arxiv.org/abs/1910.01618 (プレプリント)
説明:
-
OA-Status:

作成者

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 作成者:
René, Alexandre1, 著者
Longtin, Andre1, 著者
Macke, Jakob H2, 著者           
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              
2Max Planck Research Group Neural Systems Analysis, Center of Advanced European Studies and Research (caesar), Max Planck Society, Ludwig-Erhard-Allee 2, 53175 Bonn, DE, ou_2173683              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Understanding how rich dynamics emerge in neural populations requires models exhibiting a wide range of behaviors while remaining interpretable in terms of connectivity and single-neuron dynamics. However, it has been challenging to fit such mechanistic spiking networks at the single-neuron scale to empirical population data. To close this gap, we propose to fit such data at a mesoscale, using a mechanistic but low-dimensional and, hence, statistically tractable model. The mesoscopic representation is obtained by approximating a population of neurons as multiple homogeneous pools of neurons and modeling the dynamics of the aggregate population activity within each pool. We derive the likelihood of both single-neuron and connectivity parameters given this activity, which can then be used to optimize parameters by gradient ascent on the log likelihood or perform Bayesian inference using Markov chain Monte Carlo (MCMC) sampling. We illustrate this approach using a model of generalized integrate-and-fire neurons for which mesoscopic dynamics have been previously derived and show that both single-neuron and connectivity parameters can be recovered from simulated data. In particular, our inference method extracts posterior correlations between model parameters, which define parameter subsets able to reproduce the data. We compute the Bayesian posterior for combinations of parameters using MCMC sampling and investigate how the approximations inherent in a mesoscopic population model affect the accuracy of the inferred single-neuron parameters.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2020-08
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): ISI: 000548539700002
DOI: 10.1162/neco_a_01292
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Neural computation
  省略形 : Neural Comput
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Cambridge, Mass. : MIT Press
ページ: - 巻号: 32 (8) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1448 - 1498 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0899-7667
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925561591