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  Developments in CORG: a gene-centric comparative genomics resource.

Dieterich, C., Franz, M. W., & Vingron, M. (2007). Developments in CORG: a gene-centric comparative genomics resource. Nucleic Acids Research, 35(Database issue), D32-D35. doi:10.1093/nar/gkl977.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : NAR

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D32.pdf (beliebiger Volltext), 482KB
Name:
D32.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
eDoc_access: PUBLIC
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Dieterich, C.1, Autor
Franz, M. W.1, Autor
Vingron, Martin2, Autor           
Affiliations:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2Gene regulation (Martin Vingron), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479639              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: The CORG resource (Comparative Regulatory Genomics, http://corg.eb.tuebingen.mpg.de) provides extensive cross-species comparisons of promoter regions in particular and whole gene loci in general. Pairwise as well as multiple alignments of 10 vertebrate species form the key component of CORG. We implemented a rapid alignment approach based on weight matrix motif anchors to ensure efficient computation and biologically informative alignments. All CORG workbench components have been enhanced towards more flexibility and interactivity. Reference sequence based data presentation and analysis was put into the well-known and modular Generic Genome Browser framework. Herein, various plugins facilitate online data analysis and integration with static conservation data. Main emphasis was put on the design of a new JAVA WebStart application for comparative data display. Flexible data import and export options for standard formats complete the provided services.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2007-01-01
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nucleic Acids Research
  Alternativer Titel : NAR
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 35 (Database issue) Artikelnummer: - Start- / Endseite: D32 - D35 Identifikator: ISSN: 0305-1048