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  The genomic basis of circadian and circalunar timing adaptations in a midge

Kaiser, T. S., Poehn, B., Szkiba, D., Preussner, M., Sedlazeck, F. J., Zrim, A., et al. (2016). The genomic basis of circadian and circalunar timing adaptations in a midge. Nature, 540, 69-73. doi:10.1038/nature20151.

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Externe Referenzen

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http://dx.doi.org/10.1038/nature20151 (Verlagsversion)
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Urheber

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 Urheber:
Kaiser, Tobias S., Autor
Poehn, Birgit, Autor
Szkiba, David, Autor
Preussner, Marco, Autor
Sedlazeck, Fritz J., Autor
Zrim, Alexander, Autor
Neumann, Tobias, Autor
Nguyen, Lam-Tung, Autor
Betancourt, Andrea J., Autor
Hummel, Thomas, Autor
Vogel, Heiko1, Autor           
Dorner, Silke, Autor
Heyd, Florian, Autor
von Haeseler, Arndt, Autor
Tessmar-Raible, Kristin, Autor
Affiliations:
1Department of Entomology, Prof. D. G. Heckel, MPI for Chemical Ecology, Max Planck Society, ou_421895              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Organisms use endogenous clocks to anticipate regular environmental cycles, such as days and tides. Natural variants resulting in differently timed behaviour or physiology, known as chronotypes in humans, have not been well characterized at the molecular level. We sequenced the genome of Clunio marinus, a marine midge whose reproduction is timed by circadian and circalunar clocks. Midges from different locations show strain-specific genetic timing adaptations. We examined genetic variation in five C. marinus strains from different locations and mapped quantitative trait loci for circalunar and circadian chronotypes. The region most strongly associated with circadian chronotypes generates strain-specific differences in the abundance of calcium/calmodulin-dependent kinase II.1 (CaMKII.1) splice variants. As equivalent variants were shown to alter CaMKII activity in Drosophila melanogaster, and C. marinus (Cma)-CaMKII.1 increases the transcriptional activity of the dimer of the circadian proteins Cma-CLOCK and Cma-CYCLE, we suggest that modulation of alternative splicing is a mechanism for natural adaptation in circadian timing.

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2016-10-102016-11-212016-12-01
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: DOI: 10.1038/nature20151
Anderer: HEC355
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nature
  Kurztitel : Nature
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: London : Nature Publishing Group
Seiten: - Band / Heft: 540 Artikelnummer: - Start- / Endseite: 69 - 73 Identifikator: ISSN: 0028-0836
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925427238