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  Predicting alcohol dependence from multi‐sitebrain structural measures

Hahn, S., Mackey, S., Cousijn, J., Foxe, J. J., Heinz, A., Hester, R., Hutchinson, K., Kiefer, F., Korucuoglu, O., Lett, T., Li, C. R., London, E., Lorenzetti, V., Maartje, L., Momenan, R., Orr, C., Paulus, M., Schmaal, L., Sinha, R., Sjoerds, Z., Stein, D. J., Stein, E., Holst, R. J., Veltman, D., Walter, H., Wiers, R. W., Yucel, M., Thompson, P. M., Conrod, P., Allgaier, N., & Garavan, H. (2020). Predicting alcohol dependence from multi‐sitebrain structural measures. Human Brain Mapping. doi:10.1002/hbm.25248.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-4D33-A 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-60AD-A
資料種別: 学術論文

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:
Hahn_2020.pdf (出版社版), 2MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-4D35-8
ファイル名:
Hahn_2020.pdf
説明:
-
OA-Status:
Gold
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-

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作成者

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 作成者:
Hahn, Sage, 著者
Mackey, Scott, 著者
Cousijn, Janna, 著者
Foxe, John J., 著者
Heinz, Andreas, 著者
Hester, Robert, 著者
Hutchinson, Kent, 著者
Kiefer, Falk, 著者
Korucuoglu, Ozlem, 著者
Lett, Tristram, 著者
Li, Chiang‐Shan R., 著者
London, Edythe, 著者
Lorenzetti, Valentina, 著者
Maartje, Luijten, 著者
Momenan, Reza, 著者
Orr, Catherine, 著者
Paulus, Martin, 著者
Schmaal, Lianne, 著者
Sinha, Rajita, 著者
Sjoerds, Zsuzsika1, 著者           
Stein, Dan J., 著者Stein, Elliot, 著者Holst, Ruth J., 著者Veltman, Dick, 著者Walter, Henrik, 著者Wiers, Reinout W., 著者Yucel, Murat, 著者Thompson, Paul M., 著者Conrod, Patricia, 著者Allgaier, Nicholas, 著者Garavan, Hugh, 著者 全て表示
所属:
1Department Neurology, MPI for Human Cognitive and Brain Sciences, Max Planck Society, ou_634549              

内容説明

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キーワード: Addiction; Alcohol dependence; Genetic algorithm; Machine learning; Multi‐site; Prediction; Structural MRI
 要旨: To identify neuroimaging biomarkers of alcohol dependence (AD) from structural magnetic resonance imaging, it may be useful to develop classification models that are explicitly generalizable to unseen sites and populations. This problem was explored in a mega‐analysis of previously published datasets from 2,034 AD and comparison participants spanning 27 sites curated by the ENIGMA Addiction Working Group. Data were grouped into a training set used for internal validation including 1,652 participants (692 AD, 24 sites), and a test set used for external validation with 382 participants (146 AD, 3 sites). An exploratory data analysis was first conducted, followed by an evolutionary search based feature selection to site generalizable and high performing subsets of brain measurements. Exploratory data analysis revealed that inclusion of case‐ and control‐only sites led to the inadvertent learning of site‐effects. Cross validation methods that do not properly account for site can drastically overestimate results. Evolutionary‐based feature selection leveraging leave‐one‐site‐out cross‐validation, to combat unintentional learning, identified cortical thickness in the left superior frontal gyrus and right lateral orbitofrontal cortex, cortical surface area in the right transverse temporal gyrus, and left putamen volume as final features. Ridge regression restricted to these features yielded a test‐set area under the receiver operating characteristic curve of 0.768. These findings evaluate strategies for handling multi‐site data with varied underlying class distributions and identify potential biomarkers for individuals with current AD.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2020-09-212020-06-122020-10-062020-10-16
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1002/hbm.25248
その他: online ahead of print
PMID: 33064342
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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Project name : -
Grant ID : OAC‐1827314
Funding program : -
Funding organization : Division of Advanced Cyberinfrastructure
Project name : -
Grant ID : R01 DA018307
Funding program : -
Funding organization : National Institute of Mental Health
Project name : -
Grant ID : R01‐AA013892, ZIA AA000125‐04 DICB
Funding program : -
Funding organization : National Institute on Alcohol Abuse and Alcoholism
Project name : -
Grant ID : PL30‐1DA024859‐01, R01‐DA014100, R01‐DA020726, R01DA047119, T32DA043593, UL1‐RR24925‐01
Funding program : -
Funding organization : National Institute on Drug Abuse
Project name : -
Grant ID : U54 EB020403
Funding program : -
Funding organization : National Institutes of Health
Project name : -
Grant ID : VICI grant 453.08.01, VIDI grant 016.08.322, ZonMW grant 31160003, ZonMW grant 31160004, ZonMW grant 31180002, ZonMW grant 91676084
Funding program : -
Funding organization : Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek

出版物 1

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出版物名: Human Brain Mapping
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York : Wiley-Liss
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1065-9471
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925601686