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  Explicit proton transfer in classical molecular dynamics simulations.

Wolf, M. G., & Groenhof, G. (2014). Explicit proton transfer in classical molecular dynamics simulations. Journal of Computational Chemistry, 35(8), 657-671. doi:10.1002/jcc.23536.

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Urheber

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 Urheber:
Wolf, M. G.1, Autor           
Groenhof, G.1, Autor           
Affiliations:
1Department of Theoretical and Computational Biophysics, MPI for biophysical chemistry, Max Planck Society, ou_578631              

Inhalt

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Schlagwörter: proton transfer; λ-dynamics; force field; molecular dynamics; MC; excess proton
 Zusammenfassung: We present Hydrogen Dynamics (HYDYN), a method that allows explicit proton transfer in classical force field molecular dynamics simulations at thermodynamic equilibrium. HYDYN reproduces the characteristic properties of the excess proton in water, from the special pair dance, to the continuous fluctuation between the limiting Eigen and Zundel complexes, and the water reorientation beyond the first solvation layer. Advantages of HYDYN with respect to existing methods are computational efficiency, microscopic reversibility, and easy parameterization for any force field.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2014-02-052014-03-30
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1002/jcc.23536
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Journal of Computational Chemistry
  Alternativer Titel :
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
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Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 35 (8) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 657 - 671 Identifikator: -