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  Functional genomics, proteomics, and regulatory DNA analysis in isogenic settings using zinc finger nuclease-driven transgenesis into a safe harbor locus in the human genome

DeKelver, R. C., Choi, V. M., Moehle, E. A., Paschon, D. E., Hockemeyer, D., Meijsing, S. H., Sancak, Y., Cui, X., Steine, E. J., Miller, J. C., Tam, P., Bartsevich, V. V., Meng, X., Rupniewski, I., Gopalan, S. M., Sun, H. C., Pitz, K. J., Rock, J. M., Zhang, L., Davis, G. D., Rebar, E. J., Cheeseman, I. M., Yamamoto, K. R., Sabatini, D. M., Jaenisch, R., Gregory, P. D., & Urnov, F. D. (2010). Functional genomics, proteomics, and regulatory DNA analysis in isogenic settings using zinc finger nuclease-driven transgenesis into a safe harbor locus in the human genome. Genome Research, 20(8), 1133-1142.

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基本情報

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Genome Res

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deKelver.pdf (全文テキスト(全般)), 884KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7A97-C
ファイル名:
deKelver.pdf
説明:
-
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application/pdf / [MD5]
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-
著作権情報:
eDoc_access: PUBLIC
CCライセンス:
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作成者

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 作成者:
DeKelver, R. C., 著者
Choi, V. M., 著者
Moehle, E. A., 著者
Paschon, D. E., 著者
Hockemeyer, D., 著者
Meijsing, S. H.1, 著者           
Sancak, Y., 著者
Cui, X., 著者
Steine, E. J., 著者
Miller, J. C., 著者
Tam, P., 著者
Bartsevich, V. V., 著者
Meng, X., 著者
Rupniewski, I., 著者
Gopalan, S. M., 著者
Sun, H. C., 著者
Pitz, K. J., 著者
Rock, J. M., 著者
Zhang, L., 著者
Davis, G. D., 著者
Rebar, E. J., 著者Cheeseman, I. M., 著者Yamamoto, K. R., 著者Sabatini, D. M., 著者Jaenisch, R., 著者Gregory, P. D., 著者Urnov, F. D., 著者 全て表示
所属:
1Mechanisms of Transcriptional Regulation (Sebastiaan H. Meijsing), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479641              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Isogenic settings are routine in model organisms, yet remain elusive for genetic experiments on human cells. We describe the use of designed zinc finger nucleases (ZFNs) for efficient transgenesis without drug selection into the PPP1R12C gene, a "safe harbor" locus known as AAVS1. ZFNs enable targeted transgenesis at a frequency of up to 15% following transient transfection of both transformed and primary human cells, including fibroblasts and hES cells. When added to this locus, transgenes such as expression cassettes for shRNAs, small-molecule-responsive cDNA expression cassettes, and reporter constructs, exhibit consistent expression and sustained function over 50 cell generations. By avoiding random integration and drug selection, this method allows bona fide isogenic settings for high-throughput functional genomics, proteomics, and regulatory DNA analysis in essentially any transformed human cell type and in primary cells.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2010-08
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 536307
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Genome Research
  出版物の別名 : Genome Res
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 20 (8) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1133 - 1142 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1549-5469 (Electronic)