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  A calibrated diversity assay for nucleic acid libraries using DiStRO-a Diversity Standard of Random Oligonucleotides

Schütze, T., Arndt, P. F., Menger, M., Wochner, A., Vingron, M., Erdmann, V. A., et al. (2010). A calibrated diversity assay for nucleic acid libraries using DiStRO-a Diversity Standard of Random Oligonucleotides. Nucleic Acids Research, 38(4), e23-e23. doi:doi:10.1093/nar/gkp1108.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7BC8-5 Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7BC9-3
Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : Nucleic Acids Res

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Schütze.pdf (beliebiger Volltext), 3MB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7BC7-7
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Schütze.pdf
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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Schütze, T.1, Autor           
Arndt, P. F.2, Autor           
Menger, M., Autor
Wochner, A., Autor
Vingron, M.3, Autor           
Erdmann, V. A.4, Autor
Lehrach, H.1, Autor           
Kaps, C., Autor
Glökler, J.1, Autor           
Affiliations:
1Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433550              
2Evolutionary Genomics (Peter Arndt), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479638              
3Gene regulation (Martin Vingron), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479639              
4Max Planck Society, ou_persistent13              

Inhalt

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Schlagwörter: Calibration; DNA/standards; *Gene Library; Kinetics; Nucleic Acid Denaturation; Oligodeoxyribonucleotides/chemical synthesis/*standards; Reference Standards; SELEX Aptamer Technique; Temperature
 Zusammenfassung: We have determined diversities exceeding 10(12) different sequences in an annealing and melting assay using synthetic randomized oligonucleotides as a standard. For such high diversities, the annealing kinetics differ from those observed for low diversities, favouring the remelting curve after annealing as the best indicator of complexity. Direct comparisons of nucleic acid pools obtained from an aptamer selection demonstrate that even highly complex populations can be evaluated by using DiStRO, without the need of complicated calculations.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2010-03
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 539682
URI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&dopt=Citation&list_uids=19965765
DOI: doi:10.1093/nar/gkp1108
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nucleic Acids Research
  Alternativer Titel : Nucleic Acids Res
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 38 (4) Artikelnummer: - Start- / Endseite: e23 - e23 Identifikator: ISSN: 1362-4962 (Electronic) 0305-1048 (Linking) %R gkp1108 [pii] 10.1093/nar/gkp1108