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  A new tRNA intermediate revealed on the ribosome during EF4-mediated back-translocation

Connell, S. R., Topf, M., Qin, Y., Wilson, D. N., Mielke, T., Fucini, P., Nierhaus, K. H., & Spahn, C. M. T. (2008). A new tRNA intermediate revealed on the ribosome during EF4-mediated back-translocation. Nature Structural & Molecular Biology, 15(9), 910-915. doi:10.1038/nsmb.1469.

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Nat Struct Mol Biol

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作成者

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 作成者:
Connell, Sean R.1, 著者           
Topf, Maya, 著者
Qin, Yan2, 著者           
Wilson, Daniel N.1, 著者           
Mielke, Thorsten3, 著者           
Fucini, Paola2, 著者           
Nierhaus, Knud H.2, 著者           
Spahn, Christian M. T.1, 著者           
所属:
1Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433550              
2Ribosomes, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433558              
3Imaging/Electron Microscopy (Head: Rudi Lurz/Thorsten Mielke), Scientific Service (Head: Manuela B. Urban), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479668              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: EF4 (LepA) is an almost universally conserved translational GTPase in eubacteria. It seems to be essential under environmental stress conditions and has previously been shown to back-translocate the tRNAs on the ribosome, thereby reverting the canonical translocation reaction. In the current work, EF4 was directly visualized in the process of back-translocating tRNAs by single-particle cryo-EM. Using flexible fitting methods, we built a model of ribosome-bound EF4 based on the cryo-EM map and a recently published unbound EF4 X-ray structure. The cryo-EM map establishes EF4 as a noncanonical elongation factor that interacts not only with the elongating ribosome, but also with the back-translocated tRNA in the A-site region, which is present in a previously unseen, intermediate state and deviates markedly from the position of a canonical A-tRNA. Our results, therefore, provide insight into the underlying structural principles governing back-translocation.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2008-09
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 412554
DOI: 10.1038/nsmb.1469
URI: http://www.nature.com/nsmb/journal/v15/n9/pdf/nsmb.1469.pdf
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Structural & Molecular Biology
  出版物の別名 : Nat Struct Mol Biol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 15 (9) 通巻号: - 開始・終了ページ: 910 - 915 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1545-9993