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  A systems biology markup language (SBML) based sensitivity analysis tool

Zi, Z., Zheng, Y., Rundell, A. E., & Klipp, E. (2008). A systems biology markup language (SBML) based sensitivity analysis tool. BMC Bioinformatics, 15(9), 342-342. doi:10.1186/1471-2105-9-342.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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:
1471-2105-9-517.pdf (全文テキスト(全般)), 1020KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-7F53-9
ファイル名:
1471-2105-9-517.pdf
説明:
-
OA-Status:
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公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
eDoc_access: PUBLIC
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Zi, Zhike1, 著者           
Zheng, Yanan, 著者
Rundell, Ann E., 著者
Klipp, Edda2, 著者           
所属:
1Cell Signaling Dynamics (Zhike Zi), Independent Junior Research Groups (OWL), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_2117284              
2Independent Junior Research Groups (OWL), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433554              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Background It has long been recognized that sensitivity analysis plays a key role in modeling and analyzing cellular and biochemical processes. Systems biology markup language (SBML) has become a well-known platform for coding and sharing mathematical models of such processes. However, current SBML compatible software tools are limited in their ability to perform global sensitivity analyses of these models. Results This work introduces a freely downloadable, software package, SBML-SAT, which implements algorithms for simulation, steady state analysis, robustness analysis and local and global sensitivity analysis for SBML models. This software tool extends current capabilities through its execution of global sensitivity analyses using multi-parametric sensitivity analysis, partial rank correlation coefficient, SOBOL's method, and weighted average of local sensitivity analyses in addition to its ability to handle systems with discontinuous events and intuitive graphical user interface.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2008-08-15
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 412698
URI: http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-9-342.pdf
DOI: 10.1186/1471-2105-9-342
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: BMC Bioinformatics
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 15 (9) 通巻号: - 開始・終了ページ: 342 - 342 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -