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Datensatz

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  Analysis of fused in-situ hybridization and gene expression data.

Opitz, L., Schliep, A., & Posch, A. (2007). Analysis of fused in-situ hybridization and gene expression data. In Advances in Data Analysis (pp. 577-584). Berlin/Heidelberg: Springer.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-82DE-B Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-82DF-9
Genre: Buchkapitel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Opitz, L., Autor
Schliep, Alexander1, Autor           
Posch, A., Autor
Affiliations:
1Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433547              

Inhalt

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Schlagwörter: * Classification Clustering Data Analysis Data Mining Information Retrieval Machine Learning
 Zusammenfassung: To understand transcriptional regulation during development a detailed analysis of gene expression is needed. In-situ hybridization experiments measure the spatial distribution of mRNA-molecules and thus complement DNA-microarray experiments. This is of very high biological relevance, as co-location is a necessary condition for possible molecular interactions. We use publicly available in-situ data from embryonal development of Drosophila and derive a co-location index for pairs of genes. Our image processing pipeline for in-situ images provides a simpler alternative for the image processing part at comparable performance compared to published prior work. We formulate a mixture model which can use the pair-wise co-location indices as constraints in a mixture estimation on gene expression time-courses.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2007
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 336979
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Advances in Data Analysis
Genre der Quelle: Buch
 Urheber:
Decker, Reinhold, Autor
Lenz, Hans-Joachim, Autor
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: Berlin/Heidelberg : Springer
Seiten: XVI, 687 p. 202 illus.. Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: 577 - 584 Identifikator: ISBN: 978-3-540-70980-0

Quelle 2

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Titel: Studies in Classification, Data Analysis, and Knowledge Organization
Genre der Quelle: Reihe
 Urheber:
Decker, Reinhold, Herausgeber
Lenz, Hans-Joachim, Herausgeber
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: -