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  A genome-wide map of aberrantly expressed chromosomal islands in colorectal cancer

Staub, E., Gröne, J., Mennerich, D., Röpcke, S., Klamann, I., Hinzmann, B., Castanos-Velez, E., Mann, B., Pilarsky, C., Brümmendorf, T., Weber, B., Buhr, H.-J., & Rosenthal, A. (2006). A genome-wide map of aberrantly expressed chromosomal islands in colorectal cancer. Molecular Cancer, 5, 37-37. doi:10.1186/1476-4598-5-37.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-83A9-A 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-83AA-8
資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Mol. Cancer

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:
1476-4598-5-37.pdf (全文テキスト（全般）), 2MB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-83A8-C
ファイル名:
1476-4598-5-37.pdf
説明:
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
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-
著作権情報:
eDoc_access: PUBLIC
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Staub, Eike1, 著者
Gröne, Jörn, 著者
Mennerich, Detlev, 著者
Röpcke, Stefan1, 著者
Klamann, Irina, 著者
Hinzmann, Bernd, 著者
Castanos-Velez, Esmeralda, 著者
Mann, Benno, 著者
Pilarsky, Christian, 著者
Brümmendorf, Thomas, 著者
Weber, Birgit, 著者
Buhr, Heinz-Johannes, 著者
Rosenthal, André, 著者
所属:
1Max Planck Society, ou_persistent13              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Background: Cancer development is accompanied by genetic phenomena like deletion and amplification of chromosome parts or alterations of chromatin structure. It is expected that these mechanisms have a strong effect on regional gene expression. Results: We investigated genome-wide gene expression in colorectal carcinoma (CRC) and normal epithelial tissues from 25 patients using oligonucleotide arrays. This allowed us to identify 81 distinct chromosomal islands with aberrant gene expression. Of these, 38 islands show a gain in expression and 43 a loss of expression. In total, 7.892 genes (25.3% of all human genes) are located in aberrantly expressed islands. Many chromosomal regions that are linked to hereditary colorectal cancer show deregulated expression. Also, many known tumor genes localize to chromosomal islands of misregulated expression in CRC. Conclusion: An extensive comparison with published CGH data suggests that chromosomal regions known for frequent deletions in colon cancer tend to show reduced expression. In contrast, regions that are often amplified in colorectal tumors exhibit heterogeneous expression patterns: even show a decrease of mRNA expression. Because for several islands of deregulated expression chromosomal aberrations have never been observed, we speculate that additional mechanisms (like abnormal states of regional chromatin) also have a substantial impact on the formation of co-expression islands in colorectal carcinoma.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2006-09-18
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 311434
DOI: 10.1186/1476-4598-5-37
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Molecular Cancer
  出版物の別名 : Mol. Cancer
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 5 通巻号: - 開始・終了ページ: 37 - 37 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1476-4598