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  Genome sequence of the chlorinated compound-respiring bacterium Dehalococcoides species strain CBDB1

Kube, M., Beck, A., Zinder, S. H., Kuhl, H., Reinhardt, R., & Adrian, L. (2005). Genome sequence of the chlorinated compound-respiring bacterium Dehalococcoides species strain CBDB1. Nature Biotechnology, 23, 1269-1273. doi:10.1038/nbt1131.

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基本情報

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Nat Biotechnol

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nbt1131.pdf (全文テキスト(全般)), 231KB
 
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nbt1131.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Molecular Genetics, MBMG; )
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eDoc_access: MPG
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Kube, Michael1, 著者           
Beck, Alfred2, 著者           
Zinder, Stephen H., 著者
Kuhl, Heiner3, 著者           
Reinhardt, Richard1, 著者           
Adrian, Lorenz, 著者
所属:
1High Throughput Technologies, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433552              
2Computing (Head: Donald Buczek/Peter Marquardt), Scientific Service (Head: Christoph Krukenkamp), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479667              
3Sequencing (Head: Bernd Timmermann), Scientific Service (Head: Manuela B. Urban), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479670              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Dehalococcoides species are strictly anaerobic bacteria, which catabolize many of the most toxic and persistent chlorinated aromatics and aliphatics by reductive dechlorination and are used for in situ bioremediation of contaminated sites. Our sequencing of the complete 1,395,502 base pair genome of Dehalococcoides strain CBDB1 has revealed the presence of 32 reductive-dehalogenase-homologous (rdh) genes, possibly conferring on the bacteria an immense dehalogenating potential. Most rdh genes were associated with genes encoding transcription regulators such as two-component regulatory systems or transcription regulators of the MarR-type. Four new paralog groups of rdh-associated genes without known function were detected. Comparison with the recently sequenced genome of Dehalococcoides ethenogenes strain 195 reveals a high degree of gene context conservation (synteny) but exceptionally high plasticity in all regions containing rdh genes, suggesting that these regions are under intense evolutionary pressure.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2005-08-21
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 273063
DOI: 10.1038/nbt1131
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Biotechnology
  出版物の別名 : Nat Biotechnol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 23 通巻号: - 開始・終了ページ: 1269 - 1273 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1087-0156