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  Intronic CA-repeat and CA-rich elements: a new class of regulators of mammalian alternative splicing

Hui, J., Hung, L.-H., Heiner, M., Schreiner, S., Neumüller, N., Reither, G., et al. (2005). Intronic CA-repeat and CA-rich elements: a new class of regulators of mammalian alternative splicing. EMBO Journal, 24(11), 1988-1998. doi:10.1038/sj.emboj.7600677.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-8647-1 Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-8648-0
Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : EMBO

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:
7600677a.pdf (beliebiger Volltext), 497KB
 
Datei-Permalink:
-
Name:
7600677a.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Eingeschränkt (Max Planck Institute for Molecular Genetics, MBMG; )
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
eDoc_access: MPG
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Hui, Jingyi, Autor
Hung, Lee-Hsueh, Autor
Heiner, Monika, Autor
Schreiner, Silke, Autor
Neumüller, Norma, Autor
Reither, Gregor, Autor
Haas, Stefan A1, Autor
Bindereif, Albrecht, Autor
Affiliations:
1Max Planck Society, ou_persistent13              

Inhalt

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Schlagwörter: alternative splicing hnRNP L repetitive sequence splicing enhancer splicing silencer
 Zusammenfassung: We have recently identified an intronic polymorphic CA-repeat region in the human endothelial nitric oxide synthase (eNOS) gene as an important determinant of the splicing efficiency, requiring specific binding of hnRNP L. Here, we analyzed the position requirements of this CA-repeat element, which revealed its potential role in alternative splicing. In addition, we defined the RNA binding specificity of hnRNP L by SELEX: not only regular CA repeats are recognized with high affinity but also certain CA-rich clusters. Therefore, we have systematically searched the human genome databases for CA-repeat and CA-rich elements associated with alternative 5' splice sites (5'ss), followed by minigene transfection assays. Surprisingly, in several specific human genes that we tested, intronic CA RNA elements could function either as splicing enhancers or silencers, depending on their proximity to the alternative 5'ss. HnRNP L was detected specifically bound to these diverse CA elements. These data demonstrated that intronic CA sequences constitute novel and widespread regulatory elements of alternative splicing.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2005-05-12
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 265100
DOI: 10.1038/sj.emboj.7600677
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: EMBO Journal
  Alternativer Titel : EMBO
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 24 (11) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 1988 - 1998 Identifikator: ISSN: 0261 - 4189