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  Solvable Sequence Evolution Models and Genomic Correlations

Messer, P. W., Arndt, P. F., & Lässig, M. (2005). Solvable Sequence Evolution Models and Genomic Correlations. Physical Review Letters, 94, 138103-1-138103-4. doi:10.1103/PhysRevLett.94.138103.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : Phys. Rev. Lett.

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:
PhysRevLett_94_138103.pdf (beliebiger Volltext), 715KB
 
Datei-Permalink:
-
Name:
PhysRevLett_94_138103.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Eingeschränkt (Max Planck Institute for Molecular Genetics, MBMG; )
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
eDoc_access: MPG
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Messer, Philipp W.1, Autor
Arndt, Peter F.2, Autor           
Lässig, Michael, Autor
Affiliations:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2Evolutionary Genomics (Peter Arndt), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479638              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: We study a minimal model for genome evolution whose elementary processes are single site mutation, duplication and deletion of sequence regions, and insertion of random segments. These processes are found to generate long-range correlations in the composition of letters as long as the sequence length is growing; i.e., the combined rates of duplications and insertions are higher than the deletion rate. For constant sequence length, on the other hand, all initial correlations decay exponentially. These results are obtained analytically and by simulations. They are compared with the long-range correlations observed in genomic DNA, and the implications for genome evolution are discussed.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2005-04-05
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 267904
DOI: 10.1103/PhysRevLett.94.138103
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Physical Review Letters
  Alternativer Titel : Phys. Rev. Lett.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 94 Artikelnummer: - Start- / Endseite: 138103-1 - 138103-4 Identifikator: ISSN: 1079-7114