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  Solvable Sequence Evolution Models and Genomic Correlations

Messer, P. W., Arndt, P. F., & Lässig, M. (2005). Solvable Sequence Evolution Models and Genomic Correlations. Physical Review Letters, 94, 138103-1-138103-4. doi:10.1103/PhysRevLett.94.138103.

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基本情報

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Phys. Rev. Lett.

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PhysRevLett_94_138103.pdf (全文テキスト(全般)), 715KB
 
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ファイル名:
PhysRevLett_94_138103.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Molecular Genetics, MBMG; )
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application/pdf
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-
著作権情報:
eDoc_access: MPG
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Messer, Philipp W.1, 著者
Arndt, Peter F.2, 著者           
Lässig, Michael, 著者
所属:
1Max Planck Society, ou_persistent13              
2Evolutionary Genomics (Peter Arndt), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479638              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: We study a minimal model for genome evolution whose elementary processes are single site mutation, duplication and deletion of sequence regions, and insertion of random segments. These processes are found to generate long-range correlations in the composition of letters as long as the sequence length is growing; i.e., the combined rates of duplications and insertions are higher than the deletion rate. For constant sequence length, on the other hand, all initial correlations decay exponentially. These results are obtained analytically and by simulations. They are compared with the long-range correlations observed in genomic DNA, and the implications for genome evolution are discussed.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2005-04-05
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 267904
DOI: 10.1103/PhysRevLett.94.138103
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Physical Review Letters
  出版物の別名 : Phys. Rev. Lett.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 94 通巻号: - 開始・終了ページ: 138103-1 - 138103-4 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1079-7114