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  PSIbase: a database of Protein Structural Interactome map (PSIMAP)

Gong, S., Yoon, G., Jang, I., Bolser, D., Panos, D., Schroeder, M., Choi, H., Cho, Y., Han, K., Lee, S., Choi, H., Lappe, M., Holm, L., Kim, S., Oh, D., & Bhak, J. (2005). PSIbase: a database of Protein Structural Interactome map (PSIMAP). Bioinformatics, 21(10), 2541-2543. doi:10.1093/bioinformatics/bti366.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-86BB-E 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-86BC-C
資料種別: 学術論文

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:
Gong_05_BI.pdf (全文テキスト（全般）), 73KB
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ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0010-86BA-0
ファイル名:
Gong_05_BI.pdf
説明:
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
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著作権日付:
-
著作権情報:
eDoc_access: PUBLIC
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Gong, Sungsam, 著者
Yoon, Giseok, 著者
Jang, Insoo, 著者
Bolser, Dan, 著者
Panos, Dafas, 著者
Schroeder, Michael, 著者
Choi, Hansol, 著者
Cho, Yoobok, 著者
Han, Kyungsook, 著者
Lee, Sunghoon, 著者
Choi, Hwanho, 著者
Lappe, Michael1, 著者           
Holm, Liisa, 著者
Kim, Sangsoo, 著者
Oh, Donghoon, 著者
Bhak, Jonghwa, 著者
所属:
1Independent Junior Research Groups (OWL), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433554              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Summary: Protein Structural Interactome map (PSIMAP) is a global interaction map that describes domain–domain and protein–protein interaction information for known Protein Data Bank structures. It calculates the Euclidean distance to determine interactions between possible pairs of structural domains in proteins. PSIbase is a database and file server for protein structural interaction information calculated by the PSIMAP algorithm. PSIbase also provides an easy-to-use protein domain assignment module, interaction navigation and visual tools. Users can retrieve possible interaction partners of their proteins of interests if a significant homology assignment is made with their query sequences.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2005-03-03
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 264902
DOI: 10.1093/bioinformatics/bti366
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Bioinformatics
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 21 (10) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2541 - 2543 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1367-4803