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  Mapping of the second tetracycline binding site on the ribosomal small subunit of E.coli

Anokhina, M. M., Barta, A., Nierhaus, K. H., Spiridonova, V. A., & Kopylov, A. M. (2004). Mapping of the second tetracycline binding site on the ribosomal small subunit of E.coli. Nucleic Acids Research, 32(8), 2594-2597. doi:DOI: 10.1093/nar/gkh583.

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基本情報

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資料種別: 学術論文
その他のタイトル : Nucleic Acids Res

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 作成者:
Anokhina, Maria M., 著者
Barta, Andrea, 著者
Nierhaus, Knud H.1, 著者           
Spiridonova, Vera A., 著者
Kopylov, Alexei M., 著者
所属:
1Ribosomes, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433558              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Tetracycline blocks stable binding of aminoacyl-tRNA to the bacterial ribosomal A-site. Various tetracycline binding sites have been identified in crystals of the 30S ribosomal small subunit of Thermus thermophilus. Here we describe a direct photo- affinity modification of the ribosomal small subunits of Escherichia coli with 7-[3H]-tetracycline. To select for specific interactions, an excess of the 30S subunits over tetracycline has been used. Primer extension analysis of the 16S rRNA revealed two sites of the modifications: C936 and C948. Considering available data on tetracycline interactions with the prokaryotic 30S subunits, including the presented data (E.coli), X-ray data (T.thermophilus) and genetic data (Helicobacter pylori, E.coli), a second high affinity tetracycline binding site is proposed within the 3'-major domain of the 16S rRNA, in addition to the A-site related tetracycline binding site.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2004-05-11
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 224240
DOI: DOI: 10.1093/nar/gkh583
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nucleic Acids Research
  出版物の別名 : Nucleic Acids Res
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 32 (8) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2594 - 2597 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0305-1048