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  Combinatorics of periods in strings

Rivals, E., & Rahmann, S. (2003). Combinatorics of periods in strings. Journal of Combinatorial Theory Series A, 104(1), 95-113. doi:10.1016/S0097-3165(03)00123-7.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel
Alternativer Titel : J. Comb. Theory Ser. A

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Rivals, Eric, Autor
Rahmann, Sven1, Autor           
Affiliations:
1Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1433547              

Inhalt

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Schlagwörter: autocorrelation; strings; periods; lattice
 Zusammenfassung: We consider the set Γn of all period sets of strings of length n over a finite alphabet. We show that there is redundancy in period sets and introduce the notion of an irreducible period set. We prove that Γn is a lattice under set inclusion and does not satisfy the Jordan–Dedekind condition. We propose the first efficient enumeration algorithm for Γn and improve upon the previously known asymptotic lower bounds on the cardinality of Γn. Finally, we provide a new recurrence to compute the number of strings sharing a given period set, and exhibit an algorithm to sample uniformly period sets through irreducible period set.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2003-10
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: eDoc: 176222
ISI: 000186552200006
DOI: 10.1016/S0097-3165(03)00123-7
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Journal of Combinatorial Theory Series A
  Alternativer Titel : J. Comb. Theory Ser. A
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 104 (1) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 95 - 113 Identifikator: ISSN: 0097-3165