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  Analysis of the methylome of human embryonic stem cells employing methylated DNA immunoprecipitation coupled to next-generation sequencing

Grimm, C., & Adjaye, J. (2012). Analysis of the methylome of human embryonic stem cells employing methylated DNA immunoprecipitation coupled to next-generation sequencing. In K., Turksen (Ed.), Methods in Molecular Biology (pp. 281-295). Humana Press.

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-F045-2 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-F046-F
資料種別: 書籍の一部

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Grimm.pdf (出版社版), 416KB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-000E-F701-4
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-
著作権情報:
© 2012 Springer Science+Business Media
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Grimm, Christina1, 著者           
Adjaye, James2, 著者           
所属:
1In vitro Ligand Screening (Zoltán Konthur), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479653              
2Molecular Embryology and Aging (James Adjaye), Dept. of Vertebrate Genomics (Head: Hans Lehrach), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479654              

内容説明

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キーワード: DNA Methylation/genetics/*physiology Embryonic Stem Cells/*metabolism High-Throughput Nucleotide Sequencing/*methods Humans Immunoprecipitation/*methods
 要旨: The analysis of DNA-methylation on a genome-wide scale by next-generation sequencing techniques is an invaluable tool towards the understanding of the epigenetic basis of cellular differentiation. Methylated DNA immunoprecipitation (MeDIP) is an immunocapturing method using an antibody targeting 5-methylcytidine (5 mC) and thereby enriching methylated DNA. MeDIP combined with next-generation sequencing (MeDIP-seq) provides a powerful tool for the analysis of genome-wide DNA-methylation profiles. Here, we describe a protocol for the preparation of MeDIP samples suitable for next-generation sequencing on a Genome Analyser (Illumina).

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1007/978-1-61779-794-1_19
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Methods in Molecular Biology
種別: 連載記事
 著者・編者:
Turksen , Kursad, 編集者
所属:
-
出版社, 出版地: Humana Press
ページ: - 巻号: 873 通巻号: - 開始・終了ページ: 281 - 295 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISBN: 978-1-61779-794-1