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  Evolution of MHC class I genes in the endangered loggerhead sea turtle (Caretta caretta) revealed by 454 amplicon sequencing

Stiebens, V. A., Merino, S. E., Chain, F. J. J., & Eizaguirre, C. (2013). Evolution of MHC class I genes in the endangered loggerhead sea turtle (Caretta caretta) revealed by 454 amplicon sequencing. BMC Evolutionary Biology, 13:. doi: 10.1186/1471-2148-13-95.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

ファイル

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:
Stiebens_2013.pdf (出版社版), 859KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0013-775F-F
ファイル名:
Stiebens_2013.pdf
説明:
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公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
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著作権情報:
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CCライセンス:
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作成者

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 作成者:
Stiebens, Victor A., 著者
Merino, Sonia E., 著者
Chain, Frédéric J. J.1, 著者           
Eizaguirre, Christophe1, 著者           
所属:
1Department Evolutionary Ecology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_1445634              

内容説明

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キーワード: major histocompatibility complex; loggerhead sea turtle; trans-species polymorphism; reptiles; intermediate diversity
 要旨: Background In evolutionary and conservation biology, parasitism is often highlighted as a major selective pressure. To fight against parasites and pathogens, genetic diversity of the immune genes of the major histocompatibility complex (MHC) are particularly important. However, the extensive degree of polymorphism observed in these genes makes it difficult to conduct thorough population screenings. Methods We utilized a genotyping protocol that uses 454 amplicon sequencing to characterize the MHC class I in the endangered loggerhead sea turtle (Caretta caretta) and to investigate their evolution at multiple relevant levels of organization. Results MHC class I genes revealed signatures of trans-species polymorphism across several reptile species. In the studied loggerhead turtle individuals, it results in the maintenance of two ancient allelic lineages. We also found that individuals carrying an intermediate number of MHC class I alleles are larger than those with either a low or high number of alleles. Conclusions Multiple modes of evolution seem to maintain MHC diversity in the loggerhead turtles, with relatively high polymorphism for an endangered species.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2013-01-062013-04-172013-04-30
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1186/1471-2148-13-95
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: BMC Evolutionary Biology
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: BioMed Central
ページ: 11 S. 巻号: 13 通巻号: 95 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1471-2148
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/111000136905006