Interactive Exploration of Chemical Space with Scaffold Hunter

Wetzel, Stefan; Klein, Karsten; Renner, Steffen; Rauh, Daniel; Oprea, Tudor I.; Mutzel, Petra; Waldmann, Herbert

Interactive Exploration of Chemical Space with Scaffold Hunter

Wetzel, S., Klein, K., Renner, S., Rauh, D., Oprea, T. I., Mutzel, P., & Waldmann, H. (2009). Interactive Exploration of Chemical Space with Scaffold Hunter. Nature Chemical Biology, 5(8):, pp. 581-583; 696. Retrieved from http://dx.doi.org/10.1038/nchembio.187.

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資料種別: 学術論文

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Wetzel, Stefan¹, 著者
Klein, Karsten, 著者
Renner, Steffen¹, 著者
Rauh, Daniel², 著者
Oprea, Tudor I., 著者
Mutzel, Petra, 著者
Waldmann, Herbert³, 著者

所属:
1Max Planck Institute of Molecular Physiology, Max Planck Society, ou_1753286
2Chemical Genomics Center of the MPS, Max Planck Institute of Molecular Physiology, Max Planck Society, ou_1753292
3Abt. IV: Chemische Biologie, Max Planck Institute of Molecular Physiology, Max Planck Society, ou_1753290

内容説明

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要旨: The supporting information is composed of the following files: I. pyruvatekinasedata.zip The pyruvate kinase data set used for the analysis described in the referenced publication is contained in this file. The analysis is based on the Pyruvate Kinase Screen as published in PubChem under the assay ID 361. It contains all compounds checked in this screen together with the scaffold tree generated from it. Scaffold Hunter can be used to query the database and interactively display the scaffold tree. This file is a dump from a MySQL 5.1 database and was generated with MySQL Administrator 1.2.5. It can be restored with the same program. II. scaffoldhunter_profiles.zip Scaffold Hunter saves the user profiles either on the hard disk or in a database. The corresponding database schema is contained in this zip file. This schema must be contained in the MySQL database before Scaffold Hunter can be run. This file is a dump from a MySQL 5.1 database and was generated with MySQL Administrator 1.2.5. It can be restored with the same program. III. InstallationGuide_Databases.pdf This document describes the installation of a local MySQL database server and the graphical user interface MySQL Administrator. Restoration of the profiles and sample databases are also described. IV. run_ScaffoldHunter.bat Windows batch file to run Scaffold Hunter with 1024 MByte of Memory. V. run_ScaffoldTreeGenerator.bat Windows batch file to run ScaffoldTreeGenerator with 1024 MByte of Memory. VI. ScaffoldHunter_readme.txt Textfile with advice for the installation of Scaffold Hunter. VII. ScaffoldTreeGenerator_readme.txt Textfile with advice for the installation of ScaffoldTree Generator.

資料詳細

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言語: eng - English

日付: 出版: 2009-06-28

出版の状態: 出版

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査読: 査読あり

識別子（DOI, ISBNなど）: eDoc: 429252
URI: http://dx.doi.org/10.1038/nchembio.187

学位: -

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出版物名: Nature Chemical Biology

種別: 学術雑誌

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出版社, 出版地: -

ページ: - 巻号: 5 (8) 通巻号: 1 開始・終了ページ: 581 - 583; 696 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -

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