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  REPPER-repeats and their periodicities in fibrous proteins.

Gruber, M., Söding, J., & Lupas, A. N. (2005). REPPER-repeats and their periodicities in fibrous proteins. Nucleic Acids Research (London), 33, W239-W243. doi:10.1093/nar/gki405.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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1944249.pdf (出版社版), 714KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0017-EB6D-6
ファイル名:
1944249.pdf
説明:
-
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公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

作成者

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 作成者:
Gruber, M.1, 著者
Söding, J.2, 著者           
Lupas, A. N.1, 著者
所属:
1external, ou_persistent22              
2Research Group of Computational Biology, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_1933286              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: REPPER (REPeats and their PERiodicities) is an integrated server that detects and analyzes regions with short gapless repeats in protein sequences or alignments. It finds periodicities by Fourier Transform (FTwin) and internal similarity analysis (REPwin). FTwin assigns numerical values to amino acids that reflect certain properties, for instance hydrophobicity, and gives information on corresponding periodicities. REPwin uses self-alignments and displays repeats that reveal significant internal similarities. Both programs use a sliding window to ensure that different periodic regions within the same protein are detected independently. FTwin and REPwin are complemented by secondary structure prediction (PSIPRED) and coiled coil prediction (COILS), making the server a versatile analysis tool for sequences of fibrous proteins. REPPER is available at http://protevo.eb.tuebingen.mpg.de/repper.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2005
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1093/nar/gki405
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Nucleic Acids Research (London)
  出版物の別名 :
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Oxford : Oxford University Press
ページ: - 巻号: 33 通巻号: - 開始・終了ページ: W239 - W243 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0305-1048
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/110992357379342