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  diXa: a data infrastructure for chemical safety assessment

Hendrickx, D. M., Aerts, H. J. W. L., Caiment, F., Clark, D., Ebbels, T. M. D., Evelo, C. T., Gmuender, H., Hebels, D. G. A. J., Herwig, R., Hescheler, J., Jennen, D. G. J., Jetten, M. J. A., Kanterakis, S., Keun, H. C., Matser, V., Overington, J. P., Pilicheva, E., Sarkans, U., Segura-Lepe, M. P., Sotiriadou, I., Wittenberger, T., Wittwehr, C., Zanzi, A., & Kleinjans, J. C. S. (2015). diXa: a data infrastructure for chemical safety assessment. Bioinformatics, 31(9), 1505-1507. doi:10.1093/bioinformatics/btu827.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0026-B067-9 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002A-3B07-5
資料種別: 学術論文

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:
Hendrickx.pdf (出版社版), 105KB
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ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0026-B069-5
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Hendrickx.pdf
説明:
-
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
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著作権日付:
-
著作権情報:
© The Author 2014. Published by Oxford University Press.
CCライセンス:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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作成者

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 作成者:
Hendrickx, Diana M. , 著者
Aerts, Hugo J. W. L. , 著者
Caiment, Florian , 著者
Clark, Dominic , 著者
Ebbels, Timothy M. D. , 著者
Evelo, Chris T. , 著者
Gmuender, Hans, 著者
Hebels, Dennie G. A. J. , 著者
Herwig, Ralf1, 著者           
Hescheler, Jürgen, 著者
Jennen, Danyel G. J. , 著者
Jetten, Marlon J. A. , 著者
Kanterakis, Stathis , 著者
Keun, Hector C. , 著者
Matser, Vera, 著者
Overington, John P. , 著者
Pilicheva, Ekaterina , 著者
Sarkans, Ugis, 著者
Segura-Lepe, Marcelo P. , 著者
Sotiriadou, Isaia , 著者
Wittenberger, Timo, 著者Wittwehr, Clemens , 著者Zanzi, Antonella , 著者Kleinjans, Jos C. S. , 著者 全て表示
所属:
1Bioinformatics (Ralf Herwig), Dept. of Computational Molecular Biology (Head: Martin Vingron), Max Planck Institute for Molecular Genetics, Max Planck Society, ou_1479648              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Motivation: The field of toxicogenomics (the application of ‘-omics’ technologies to risk assessment of compound toxicities) has expanded in the last decade, partly driven by new legislation, aimed at reducing animal testing in chemical risk assessment but mainly as a result of a paradigm change in toxicology towards the use and integration of genome wide data. Many research groups worldwide have generated large amounts of such toxicogenomics data. However, there is no centralized repository for archiving and making these data and associated tools for their analysis easily available. Results: The Data Infrastructure for Chemical Safety Assessment (diXa) is a robust and sustainable infrastructure storing toxicogenomics data. A central data warehouse is connected to a portal with links to chemical information and molecular and phenotype data. diXa is publicly available through a user-friendly web interface. New data can be readily deposited into diXa using guidelines and templates available online. Analysis descriptions and tools for interrogating the data are available via the diXa portal.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2014-12-122015-05-01
 出版の状態: 出版
 ページ: 3
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1093/bioinformatics/btu827
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Bioinformatics
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Oxford : Oxford University Press
ページ: - 巻号: 31 (9) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1505 - 1507 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1367-4803
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954926969991