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  The Genome Landscape of the Somatic Linker Histone Subtypes H1.1 to H1.5 in Human Cells

Izzo, A., Kamieniarz-Gdula, K., Ramirez, F., Noureen, N., Kind, J., Manke, T., van Steensel, B., & Schneider, R. (2013). The Genome Landscape of the Somatic Linker Histone Subtypes H1.1 to H1.5 in Human Cells. Cell Reports, 3, 2142-2154.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Izzo, Annalisa1, 著者           
Kamieniarz-Gdula, Kinga2, 著者
Ramirez, Fidel2, 著者
Noureen, Nighat2, 著者
Kind, Jop, 著者
Manke, Thomas3, 著者           
van Steensel, Bas, 著者
Schneider, Robert1, 著者           
所属:
1Spemann Laboratory, Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics, Max Planck Society, ou_2243655              
2Max Planck Society, ou_persistent13              
3Department of Epigenetics, Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics, Max Planck Society, ou_2243644              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Human cells contain five canonical, replication-dependent somatic histone H1 subtypes (H1.1, H1.2, H1.3, H1.4, and H1.5). Although they are key chromatin components, the genomic distribution of the H1 subtypes is still unknown, and their role in chromatin processes has thus far remained elusive. Here, we map the genomic localization of all somatic replication-dependent H1 subtypes in human lung fibroblasts using an integrative DNA adenine methyltransferase identification (DamID) analysis. We find in general that H1.2 to H1.5 are depleted from CpG-dense regions and active regulatory regions. H1.1 shows a DamID binding profile distinct from the other subtypes, suggesting a unique function. H1 subtypes can mark specific domains and repressive regions, pointing toward a role for H1 in three-dimensional genome organization. Our work integrates H1 subtypes into the epigenome maps of human cells and provides a valuable resource to refine our understanding of the significance of H1 and its heterogeneity in the control of genome function.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2013-06-27
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 675928
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Cell Reports
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 3 通巻号: - 開始・終了ページ: 2142 - 2154 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -