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  RNA-Seq transcriptome analysis of direction-selective T4/T5 neurons in Drosophila

Pankova, K., & Borst, A. (2016). RNA-Seq transcriptome analysis of direction-selective T4/T5 neurons in Drosophila. PLoS One, 11(9):. doi:10.1371/journal.pone.0163986.

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資料種別: 学術論文

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journal.pone.0163986.PDF (出版社版), 2MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002C-0A28-6
ファイル名:
journal.pone.0163986.PDF
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application/pdf / [MD5]
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著作権情報:
© 2016 Pankova, Borst. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License
CCライセンス:
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作成者

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 作成者:
Pankova, Katarina1, 著者           
Borst, Alexander1, 著者           
所属:
1Department: Circuits-Computation-Models / Borst, MPI of Neurobiology, Max Planck Society, ou_1113548              

内容説明

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キーワード: MOTION DETECTION; FUNCTIONAL SPECIALIZATION; NEURAL CIRCUIT; PATHWAYS; VISION; GABA; DETECTOR; SYSTEM; FLY; COMPUTATIONScience & Technology - Other Topics;
 要旨: Neuronal computation underlying detection of visual motion has been studied for more than a half-century. In Drosophila, direction-selective T4/T5 neurons show supralinear signal amplification in response to stimuli moving in their preferred direction, in agreement with the prediction made by the Hassenstein-Reichardt detector. Nevertheless, the molecular mechanism explaining how the Hassenstein-Reichardt model is implemented in T4/T5 cells has not been identified yet. In the present study, we utilized cell type-specific transcriptome profiling with RNA-seq to obtain a complete gene expression profile of T4/T5 neurons. We analyzed the expression of genes that affect neuronal computational properties and can underlie the molecular implementation of the core features of the Hassenstein-Reichardt model to the dendrites of T4/T5 neurons. Furthermore, we used the acquired RNA-seq data to examine the neurotransmitter system used by T4/T5 neurons. Surprisingly, we observed co-expression of the cholinergic markers and the vesicular GABA transporter in T4/T5 neurons. We verified the previously undetected expression of vesicular GABA transporter in T4/T5 cells using VGAT-LexA knock-in line. The provided gene expression dataset can serve as a useful source for studying the properties of direction-selective T4/T5 neurons on the molecular level.

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言語: eng - English
 日付: 2016-09-29
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): ISI: 000384328500146
DOI: 10.1371/journal.pone.0163986
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: PLoS One
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: San Francisco, CA : Public Library of Science
ページ: - 巻号: 11 (9) 通巻号: e0163986 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1932-6203
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1000000000277850