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  Epigenomic Profiling of Human CD4+ T Cells Supports a Linear Differentiation Model and Highlights Molecular Regulators of Memory Development

Durek, P., Nordström, K., Gasparoni, G., Salhab, A., Kressler, C., de Almeida, M., Bassler, K., Ulas, T., Schmidt, F., Xiong, J., Glažar, P., Klironomos, F., Sinha, A., Kinkley, S., Yang, X., Arrigoni, L., Amirabad, A. D., Ardakani, F. B., Feuerbach, L., Gorka, O., Ebert, P., Müller, F., Li, N., Frischbutter, S., Schlickeiser, S., Cendon, C., Fröhler, S., Felder, B., Gasparoni, N., Imbusch, C. D., Hutter, B., Zipprich, G., Tauchmann, Y., Reinke, S., Wassilew, G., Hoffmann, U., Richter, A. S., Sieverling, L., Consortium, D., Chang, H.-D., Syrbe, U., Kalus, U., Eils, J., Brors, B., Manke, T., Ruland, J., Lengauer, T., Rajewsky, N., Chen, W., Dong, J., Sawitzki, B., Chung, H.-R., Rosenstiel, P., Schulz, M. H., Schultze, J. L., Radbruch, A., Walter, J., Hamann, A., & Polansky, J. K. (2016). Epigenomic Profiling of Human CD4+ T Cells Supports a Linear Differentiation Model and Highlights Molecular Regulators of Memory Development. Immunity, 45, 1148-1161. doi:10.1016/j.immuni.2016.10.022.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002C-AF37-7 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0008-9B03-6
資料種別: 学術論文

ファイル

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作成者

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 作成者:
Durek, Pawel1, 著者
Nordström, Karl1, 著者
Gasparoni, Gilles1, 著者
Salhab, Abdulrahman1, 著者
Kressler, Christopher1, 著者
de Almeida, Melanie1, 著者
Bassler, Kevin1, 著者
Ulas, Thomas1, 著者
Schmidt, Florian1, 著者
Xiong, Jieyi1, 著者
Glažar, Petar1, 著者
Klironomos, Filippos1, 著者
Sinha, Anupam1, 著者
Kinkley, Sarah1, 著者
Yang, Xinyi1, 著者
Arrigoni, Laura1, 著者
Amirabad, Azim Dehghani1, 著者
Ardakani, Fatemeh Behjati1, 著者
Feuerbach, Lars1, 著者
Gorka, Oliver1, 著者
Ebert, Peter1, 著者Müller, Fabian1, 著者Li, Na1, 著者Frischbutter, Stefan1, 著者Schlickeiser, Stephan1, 著者Cendon, Carla1, 著者Fröhler, Sebastian1, 著者Felder, Bärbel1, 著者Gasparoni, Nina1, 著者Imbusch, Charles D.1, 著者Hutter, Barbara1, 著者Zipprich, Gideon1, 著者Tauchmann, Yvonne1, 著者Reinke, Simon1, 著者Wassilew, Georgi1, 著者Hoffmann, Ute1, 著者Richter, Andreas S.1, 著者Sieverling, Lina1, 著者Consortium, DEEP1, 著者Chang, Hyun-Dong1, 著者Syrbe, Uta1, 著者Kalus, Ulrich1, 著者Eils, Jürgen1, 著者Brors, Benedikt1, 著者Manke, Thomas2, 著者Ruland, Jürgen1, 著者Lengauer, Thomas1, 著者Rajewsky, Nikolaus1, 著者Chen, Wei1, 著者Dong, Jun1, 著者Sawitzki, Birgit1, 著者Chung, Ho-Ryun1, 著者Rosenstiel, Philip1, 著者Schulz, Marcel H.1, 著者Schultze, Joachim L.1, 著者Radbruch, Andreas1, 著者Walter, Jörn1, 著者Hamann, Alf1, 著者Polansky, Julia K.1, 著者 全て表示
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              
2Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics, Max Planck Society, 79108 Freiburg, DE, ou_2243640              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The impact of epigenetics on the differentiation of memory T (Tmem) cells is poorly defined. We generated deep epigenomes comprising genome-wide profiles of DNA methylation, histone modifications, DNA accessibility, and coding and non-coding RNA expression in naive, central-, effector-, and terminally differentiated CD45RA+ CD4+ Tmem cells from blood and CD69+ Tmem cells from bone marrow (BM-Tmem). We observed a progressive and proliferation-associated global loss of DNA methylation in heterochromatic parts of the genome during Tmem cell differentiation. Furthermore, distinct gradually changing signatures in the epigenome and the transcriptome supported a linear model of memory development in circulating T cells, while tissue-resident BM-Tmem branched off with a unique epigenetic profile. Integrative analyses identified candidate master regulators of Tmem cell differentiation, including the transcription factor FOXP1. This study highlights the importance of epigenomic changes for Tmem cell biology and demonstrates the value of epigenetic data for the identification of lineage regulators.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2016-11-15
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1016/j.immuni.2016.10.022
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Immunity
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Cambridge, Mass. : Cell Press
ページ: - 巻号: 45 通巻号: - 開始・終了ページ: 1148 - 1161 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1074-7613
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925604783