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  WIsH: Who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs.

Galiez, C., Siebert, M., Enault, F., Vincent, J., & Söding, J. (2017). WIsH: Who is the host? Predicting prokaryotic hosts from metagenomic phage contigs. Bioinformatics, 33(19), 3113-3114. doi:10.1093/bioinformatics/btx383.

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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Galiez, C.1, Autor           
Siebert, M.1, Autor           
Enault, F., Autor
Vincent, J., Autor
Söding, J.1, Autor           
Affiliations:
1Research Group of Computational Biology, MPI for Biophysical Chemistry, Max Planck Society, ou_1933286              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: WIsH predicts prokaryotic hosts of phages from their genomic sequences. It achieves 63% mean accuracy when predicting the host genus among 20 genera for 3 kbp-long phage contigs. Over the best current tool, WisH shows much improved accuracy on phage sequences of a few kbp length and runs hundreds of times faster, making it suited for metagenomics studies.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2017-07-132017-10-01
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1093/bioinformatics/btx383
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Bioinformatics
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
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Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 33 (19) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 3113 - 3114 Identifikator: -