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  Value, but high costs in post-deposition data curation

ten Hoopen, P., Amid, C., Buttigieg, P. L., Pafilis, E., Bravakos, P., Cerdeño-Tárraga, A. M., et al. (2016). Value, but high costs in post-deposition data curation. Database (Oxford), online: online, pp. 1-10.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0001-C353-5 Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0006-800B-D
Genre: Zeitschriftenartikel

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:
Pereira_16.pdf (Verlagsversion), 908KB
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Datei-Permalink:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0006-800C-C
Name:
Pereira_16.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
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-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
ten Hoopen, Petra, Autor
Amid, Clara, Autor
Buttigieg, Pier Luigi1, Autor           
Pafilis, Evangelos, Autor
Bravakos, Panos, Autor
Cerdeño-Tárraga, Ana M., Autor
Gibson, Richard, Autor
Kahlke, Tim, Autor
Legaki, Aglaia, Autor
Narayana Murthy, Kada, Autor
Papastefanou, Gabriella, Autor
Pereira, Emiliano2, Autor           
Rossello, Marc, Autor
Toribio, Ana Luisa, Autor
Cochrane, Guy, Autor
Affiliations:
1HGF MPG Joint Research Group for Deep Sea Ecology & Technology, Max Planck Institute for Marine Microbiology, Max Planck Society, ou_2481702              
2Microbial Genomics Group, Department of Molecular Ecology, Max Planck Institute for Marine Microbiology, Max Planck Society, ou_2481697              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Discoverability of sequence data in primary data archives is proportional to the richness of contextual information associated with the data. Here, we describe an exercise in the improvement of contextual information surrounding sample records associated with metagenomics sequence reads available in the European Nucleotide Archive. We outline the annotation process and summarize findings of this effort aimed at increasing usability of publicly available environmental data. Furthermore, we emphasize the benefits of such an exercise and detail its costs. We conclude that such a third party annotation approach is expensive and has value as an element of curation, but should form only part of a more sustainable submitter-driven approach.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2016-02-09
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: 10
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Interne Begutachtung
 Identifikatoren: eDoc: 733252
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Database (Oxford)
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: online Artikelnummer: online Start- / Endseite: 1 - 10 Identifikator: -