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  Current view on phytoplasma genomes and encoded metabolism

Kube, M., Mitrovic, J., Duduk, B., Rabus, R., & Seemueller, E. (2012). Current view on phytoplasma genomes and encoded metabolism. The ScientificWorld journal, 1-25.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0001-C8C3-1 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-670E-7
資料種別: 学術論文

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:
Kube12.pdf (出版社版), 3MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-670F-6
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Kube12.pdf
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application/pdf / [MD5]
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著作権情報:
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作成者

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 作成者:
Kube, M.1, 著者           
Mitrovic, J., 著者
Duduk, B., 著者
Rabus, R.2, 著者           
Seemueller, E., 著者
所属:
1Department of Molecular Ecology, Max Planck Institute for Marine Microbiology, Max Planck Society, ou_2481696              
2Department of Microbiology, Max Planck Institute for Marine Microbiology, Max Planck Society, ou_2481695              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Phytoplasmas are specialised bacteria that are obligate parasites of plant phloem tissue and insects. These bacteria have resisted all attempts of cell-free cultivation. Genome research is of particular importance to analyse the genetic endowment of such bacteria. Here we review the gene content of the four completely sequenced ‘Candidatus Phytoplasma’ genomes that include those of ‘Ca. P. asteris’ strains OY-M and AY-WB, ‘Ca. P. australiense,’ and ‘Ca. P. mali’. These genomes are characterized by chromosome condensation resulting in sizes below 900 kb and a G + C content of less than 28%. Evolutionary adaption of the phytoplasmas to nutrient-rich environments resulted in losses of genetic modules and increased host dependency highlighted by the transport systems and limited metabolic repertoire. On the other hand, duplication and integration events enlarged the chromosomes and contribute to genome instability. Present differences in the content of membrane and secreted proteins reflect the host adaptation in the phytoplasma strains. General differences are obvious between different phylogenetic subgroups. ‘Ca. P. mali’ is separated from the other strains by its deviating chromosome organization, the genetic repertoire for recombination and excision repair of nucleotides or the loss of the complete energy-yielding part of the glycolysis. Apart from these differences, comparative analysis exemplified that all four phytoplasmas are likely to encode an alternative pathway to generate pyruvate and ATP.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012
 出版の状態: 出版
 ページ: 26
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 646529
 学位: -

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Project information

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出版物 1

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出版物名: The ScientificWorld journal
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Hindawi Publishing Corporation
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 1 - 25 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1537-744X
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1537-744X