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  A Guide to Computational Methods for Predicting Mitochondrial Localization

Sun, S., & Habermann, B. H. (2017). A Guide to Computational Methods for Predicting Mitochondrial Localization. In D., Mokranjac, & F., Perocchi (Eds.), Mitochondria (pp. 1-14). New York, NY: Humana Press.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002E-80ED-8 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002E-80EE-6
資料種別: 書籍の一部

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作成者

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 作成者:
Sun, Su1, 著者           
Habermann, Bianca H.1, 著者           
所属:
1Habermann, Bianca / Computational Biology, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1832284              

内容説明

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キーワード: PROTEIN SUBCELLULAR-LOCALIZATION; TARGETING SEQUENCES; SORTING SIGNALS; CLEAVAGE SITES; PROTEOMES; PSORT; DATABASE; DISEASE; IMPORT; MOTIFSMitochondrial targeting peptide; Mitochondrial protein localization; In silico; Prediction methods; Protein localization algorithms;
 要旨: Predicting mitochondrial localization of proteins remains challenging for two main reasons: (1) Not only one but several mitochondrial localization signals exist, which primarily dictate the final destination of a protein in this organelle. However, most localization prediction algorithms rely on the presence of a so-called presequence (or N-terminal mitochondrial targeting peptide, mTP), which occurs in only similar to 70% of mitochondrial proteins. (2) The presequence is highly divergent on sequence level and therefore difficult to identify on the computer. In this chapter, we review a number of protein localization prediction programs and propose a strategy to predict mitochondrial localization. Finally, we give some helpful suggestions for bench scientists when working with mitochondrial protein candidates in silico.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2017
 出版の状態: 出版
 ページ: 14
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: ISI: 000411874900002
DOI: 10.1007/978-1-4939-6824-4_1
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Mitochondria
  副タイトル : Practical Protocols
  その他 : Methods in Molecular Biology, vol 1567
種別: 書籍
 著者・編者:
Mokranjac, D., 編集者
Perocchi, F., 編集者
所属:
-
出版社, 出版地: New York, NY : Humana Press
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 1 - 14 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1064-3745
ISBN: 978-1-4939-6824-4; 978-1-4939-6822-0

出版物 2

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出版物名: Methods in Molecular Biology
  出版物の別名 : METHODS MOL BIOL
  出版物の別名 : Methods Mol. Biol.
種別: 連載記事
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 1567 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1064-3745