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  Label-Free Quantitative Analysis of Mitochondrial Proteomes Using the Multienzyme Digestion-Filter Aided Sample Preparation (MED-FASP) and “Total Protein Approach”

Wisniewski, J. R. (2017). Label-Free Quantitative Analysis of Mitochondrial Proteomes Using the Multienzyme Digestion-Filter Aided Sample Preparation (MED-FASP) and “Total Protein Approach”. In D. Mokranjac, & F. Perocchi (Eds.), Mitochondria (pp. 69-77). New York, NY: Humana Press.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002E-80F2-B Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002E-80F3-9
Genre: Buchkapitel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Wisniewski, Jacek R.1, Autor           
Affiliations:
1Mann, Matthias / Proteomics and Signal Transduction, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565159              

Inhalt

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Schlagwörter: QUANTIFICATION; DEPTHProteomic sample preparation; Multienzyme Digestion-Filter Aided Sample Preparation (MED-FASP); "Total Protein Approach"; Absolute protein quantitation; WF-assay;
 Zusammenfassung: Determination of proteome composition and measuring of changes in protein titers provide important information with a substantial value for studying mitochondria. This chapter describes a workflow for the quantitative analysis of mitochondrial proteome with a focus on sample preparation and quantitative analysis of the data. The workflow involves the multienzyme digestion-filter aided sample preparation (MED-FASP) protocol enabling efficient extraction of proteins and high rate of protein-to-peptide conversion. Consecutive protein digestion with Lys C and trypsin enables generation of peptide fractions with minimal overlap, largely increases the number of identified proteins, and extends their sequence coverage. Abundances of proteins identified by multiple peptides can be assessed by the "Total Protein Approach."

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2017
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: 9
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: ISI: 000411874900007
DOI: 10.1007/978-1-4939-6824-4_6
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Mitochondria
  Untertitel : Practical Protocols
  Andere : Methods in Molecular Biology
Genre der Quelle: Buch
 Urheber:
Mokranjac, D., Herausgeber
Perocchi, F., Herausgeber
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: New York, NY : Humana Press
Seiten: - Band / Heft: 1567 Artikelnummer: - Start- / Endseite: 69 - 77 Identifikator: ISSN: 1064-3745
ISBN: 978-1-4939-6824-4; 978-1-4939-6822-0

Quelle 2

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Titel: Methods in Molecular Biology
  Alternativer Titel : METHODS MOL BIOL
  Alternativer Titel : Methods Mol. Biol.
Genre der Quelle: Reihe
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 1567 Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 1064-3745