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  Computational design of environmental sensors for the potent opioid fentanyl

Bick, M. J., Greisen, P. J., Morey, K. J., Antunes, M. S., La, D., Sankaran, B., et al. (2017). Computational design of environmental sensors for the potent opioid fentanyl. eLife, 6: e28909, pp. 1-23. doi:10.7554/eLife.28909.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002E-344C-D Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0000-2A42-7
Genre: Zeitschriftenartikel

Dateien

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:
eLlife_6_2017_e28909.pdf (beliebiger Volltext), 5MB
 
Datei-Permalink:
-
Name:
eLlife_6_2017_e28909.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Eingeschränkt (Max Planck Institute for Medical Research, MHMF; )
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-
:
eLlife_6_2017_e28909_Suppl.pdf (Ergänzendes Material), 13MB
 
Datei-Permalink:
-
Name:
eLlife_6_2017_e28909_Suppl.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Eingeschränkt (Max Planck Institute for Medical Research, MHMF; )
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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externe Referenz:
https://elifesciences.org/articles/28909#downloads (beliebiger Volltext)
Beschreibung:
-
OA-Status:
externe Referenz:
https://doi.org/10.7554/eLife.28909 (beliebiger Volltext)
Beschreibung:
-
OA-Status:

Urheber

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 Urheber:
Bick, Matthew J, Autor
Greisen, Per J, Autor
Morey, Kevin J, Autor
Antunes, Mauricio S, Autor
La, David, Autor
Sankaran, Banumathi, Autor
Reymond, Luc1, Autor           
Johnsson, Kai2, Autor           
Medford, June I, Autor
Baker, David, Autor
Affiliations:
1Max Planck Institute for Medical Research, Max Planck Society, ou_1125545              
2Chemical Biology, Max Planck Institute for Medical Research, Max Planck Society, ou_2364732              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: We describe the computational design of proteins that bind the potent analgesic fentanyl. Our approach employs a fast docking algorithm to find shape complementary ligand placement in protein scaffolds, followed by design of the surrounding residues to optimize binding affinity. Co-crystal structures of the highest affinity binder reveal a highly preorganized binding site, and an overall architecture and ligand placement in close agreement with the design model. We use the designs to generate plant sensors for fentanyl by coupling ligand binding to design stability. The method should be generally useful for detecting toxic hydrophobic compounds in the environment.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2017-05-232017-09-182017-09-19
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: 23
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.7554/eLife.28909
URI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28925919
URI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5655540/
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: eLife
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Cambridge : eLife Sciences Publications
Seiten: - Band / Heft: 6 Artikelnummer: e28909 Start- / Endseite: 1 - 23 Identifikator: Anderer: 2050-084X
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2050-084X