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  Convolutional networks can learn to generate affinity graphs for image segmentation

Turaga, S. C., Murray, J. F., Jain, V., Roth, F., Helmstaedter, M., Briggman, K., Denk, W., & Seung, H. S. (2010). Convolutional networks can learn to generate affinity graphs for image segmentation. Neural computation, 22(2), 511-538. doi:10.1162/neco.2009.10-08-881.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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NeuralComput_22_2010_511.pdf (全文テキスト(全般)), 824KB
 
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NeuralComput_22_2010_511.pdf
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制限付き (Max Planck Institute for Medical Research, MHMF; )
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application/pdf
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CCライセンス:
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https://doi.org/10.1162/neco.2009.10-08-881 (全文テキスト(全般))
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作成者

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 作成者:
Turaga, Srinivas C., 著者
Murray, Joseph F., 著者
Jain, Viren, 著者
Roth, Fabian, 著者
Helmstaedter, Moritz1, 2, 著者           
Briggman, Kevin1, 著者           
Denk, Winfried1, 著者           
Seung, H. Sebastian, 著者
所属:
1Department of Biomedical Optics, Max Planck Institute for Medical Research, Max Planck Society, ou_1497699              
2Department of Cell Physiology, Max Planck Institute for Medical Research, Max Planck Society, ou_1497701              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Many image segmentation algorithms first generate an affinity graph and then partition it. We present a machine learning approach to computing an affinity graph using a convolutional network (CN) trained using ground truth provided by human experts. The CN affinity graph can be paired with any standard partitioning algorithm and improves segmentation accuracy significantly compared to standard hand−designed affinity functions.

We apply our algorithm to the challenging 3D segmentation problem of reconstructing neuronal processes from volumetric electron microscopy (EM) and show that we are able to learn a good affinity graph directly from the raw EM images. Further, we show that our affinity graph improves the segmentation accuracy of both simple and sophisticated graph partitioning algorithms.

In contrast to previous work, we do not rely on prior knowledge in the form of hand−designed image features or image preprocessing. Thus, we expect our algorithm to generalize effectively to arbitrary image types

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2008-09-102009-05-142010-02-01
 出版の状態: 出版
 ページ: 29
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Neural computation
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Cambridge, Mass. : MIT Press
ページ: - 巻号: 22 (2) 通巻号: - 開始・終了ページ: 511 - 538 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0899-7667
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925561591