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  QM/MM Studies on Photoisomerization Dynamics of Azobenzene Chromophore Tethered to a DNA Duplex: Local Unpaired Nucleobase Plays a Crucial Role

Wu, D., Wang, Y.-T., Fang, W.-H., Cui, W., & Thiel, W. (2018). QM/MM Studies on Photoisomerization Dynamics of Azobenzene Chromophore Tethered to a DNA Duplex: Local Unpaired Nucleobase Plays a Crucial Role. Chemistry – An Asian Journal, 13(7), 780-784. doi:10.1002/asia.201800006.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0001-6947-A Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0003-1814-C
Genre: Zeitschriftenartikel

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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Wu, Dan1, Autor
Wang, Ya-Ting1, Autor
Fang, Wei-Hai1, Autor
Cui, Wanglong1, Autor
Thiel, Walter2, Autor           
Affiliations:
1Key Laboratory of Theoretical and Computational Photochemistry, Ministry of Education, College of Chemistry, Beijing Normal University, Beijing, China, ou_persistent22              
2Research Department Thiel, Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Max Planck Society, ou_1445590              

Inhalt

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Schlagwörter: azobenzene; DNA; mechanics; photoswitches; surface-hopping dynamics
 Zusammenfassung: The photoresponsive azobenzene‐tethered DNAs have received growing experimental attention because of their potential applications in biotechnology and nanotechnology; however, little is known about the initial photoisomerization of azobenzene in these systems. Herein we have employed quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) methods to explore the photoisomerization dynamics of an azobenzene‐tethered DNA duplex. We find that in the S1 state the trans–cis photoisomerization path is much steeper in DNA than in vacuo, which makes the photoisomerization much faster in the DNA environment. This acceleration is primarily caused by complex steric interactions between azobenzene and the nearby unpaired thymine nucleobase, which also change the photoisomerization mechanism of azobenzene in the DNA duplex.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2018-01-022018-02-152018-04-04
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: 5
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1002/asia.201800006
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Chemistry – An Asian Journal
  Andere : Chem. – Asian J.
  Andere : Chem. Asian J.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Weinheim : Wiley-VCH
Seiten: - Band / Heft: 13 (7) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 780 - 784 Identifikator: ISSN: 1861-4728
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1000000000223780