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  Nighres: Processing tools for high-resolution neuroimaging

Huntenburg, J. M., Steele, C., & Bazin, P.-L. (2018). Nighres: Processing tools for high-resolution neuroimaging. GigaScience, 7(7): giy082. doi:10.1093/gigascience/giy082.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

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:
Huntenburg_2018.pdf (Preprint), 761KB
Name:
Huntenburg_2018.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-
:
Huntenburg_Steele_2018.pdf (Verlagsversion), 2MB
Name:
Huntenburg_Steele_2018.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Huntenburg, Julia M.1, 2, Autor           
Steele, Christopher3, 4, Autor           
Bazin, Pierre-Louis3, 5, 6, Autor           
Affiliations:
1Max Planck Research Group Neuroanatomy and Connectivity, MPI for Human Cognitive and Brain Sciences, Max Planck Society, ou_1356546              
2Neurocomputation and Neuroimaging Unit, FU Berlin, Germany, ou_persistent22              
3Department Neurology, MPI for Human Cognitive and Brain Sciences, Max Planck Society, ou_634549              
4Cerebral Imaging Center, Douglas Mental Health University Institute, McGill University, Montréal, QC, Canada, ou_persistent22              
5Department Neurophysics, MPI for Human Cognitive and Brain Sciences, Max Planck Society, Leipzig, DE, ou_634550              
6Department of Psychology, University of Amsterdam, the Netherlands, ou_persistent22              

Inhalt

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Schlagwörter: Neuroimaging in Python; High-resolution MRI; Ultra-high field MRI; Laminar MRI; Python Java integration
 Zusammenfassung: With recent improvements in human magnetic resonance imaging (MRI) at ultra-high fields, the amount of data collected per subject in a given MRI experiment has increased considerably. Standard image processing packages are often challenged by the size of these data and dedicated methods are needed to leverage their extraordinary spatial resolution. Here we introduce a flexible Python toolbox which implements a set of advanced techniques for high-resolution neuroimaging. With these tools, segmentation and laminar analysis of cortical MRI data can be performed at resolutions up to 500 μm in reasonable times. Comprehensive online documentation makes the toolbox easy to use and install. An extensive developer’s guide encourages contributions of other researchers that will help to accelerate progress in the promising field of high-resolution neuroimaging.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2018-06-262018-06-272018-06-292018-07-04
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1093/gigascience/giy082
PMC: PMC6065481
PMID: 29982501
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Projektname : -
Grant ID : -
Förderprogramm : Google Summer of Code 2017 Program
Förderorganisation : Google
Projektname : -
Grant ID : -
Förderprogramm : -
Förderorganisation : International Neuroinformatics Coordinating Facility (INCF)

Quelle 1

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Titel: GigaScience
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: London : BioMed Central
Seiten: - Band / Heft: 7 (7) Artikelnummer: giy082 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 2047-217X
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2047-217X